ARN ribosomique 28S - 28S ribosomal RNA
L'ARN ribosomique 28S est l'ARN ribosomique structurel (ARNr) de la grande sous-unité (LSU) des ribosomes cytoplasmiques eucaryotes, et donc l'un des composants de base de toutes les cellules eucaryotes. Il a une taille de 25S chez les plantes et de 28S chez les mammifères, d'où l'alias de l'ARNr 25S-28S .
Combiné avec l'ARNr 5.8S du côté 5', c'est l'homologue nucléaire eucaryote des ARN ribosomiques procaryotes 23S et mitochondriaux 16S .
Utilisation en phylogénie
Les gènes codant pour l'ARNr 28S sont appelés ADNr 28S. La comparaison des séquences de ces gènes est parfois utilisée en analyse moléculaire pour construire des arbres phylogénétiques , par exemple chez les protistes , les champignons , les insectes , les tardigrades et les vertébrés .
Structure
L'ARNr 28S a généralement une longueur de 4000 à 5000 nt.
Certains eucaryotes clivent l'ARNr 28S en deux parties avant de les assembler dans le ribosome, un phénomène appelé "rupture cachée".
Bases de données
Plusieurs bases de données fournissent des alignements et des annotations de séquences d'ARNr LSU à des fins de comparaison :
- RDP, le projet de base de données ribosomique ;
- SILVA, un projet de base de données de gènes d'ARN ribosomique.