Alamethicine - Alamethicin

Alamethicine

Noms
Nom IUPAC N -acétyl-2-méthylalanyl- L -prolyl-2-méthylalanyl- L -alanyl-2-méthylalanyl- L -alanyl- L -glutaminyl-2-méthylalanyl- L -valyl-2-méthylalanylglycyl- L -leucyl-2- méthylalanyl- L -prolyl- L -valyl-2-méthylalanyl-2-méthylalanyl- L -α-glutamyl- N 1 -[(1 S )-1-benzyl-2-hydroxyéthyl]- L -glutamamide
Identifiants
Numero CAS
Modèle 3D ( JSmol )
ChEMBL
ChemSpider
Carte d'information de l'ECHA	100.121.626
CID PubChem
UNII
Tableau de bord CompTox ( EPA )
InChI InChI=1S/C92H150N22O25/c1-47(2)43-58(72(127)108-92(24,25)84(139)113-41-29-33-59(113)73(128)103- 65(48(3)4)75(130)111-90(20,21)82(137)112-89(18,19)80(135)102-56(37-40-64(120)121) 70(125)101-55(35-38-61(93)117)69(124)98-54(46-115)44-53-31-27-26-28-32-53)99-63( 119)45-95-77(132)85(10,11)110-76(131)66(49(5)6)104-81(136)88(16,17)107-71(126)57( 36-39-62(94)118)100-67(122)50(7)96-78(133)86(12,13)106-68(123)51(8)97-79(134)87( 14,15)109-74(129)60-34-30-42-114(60)83(138)91(22,23)105-52(9)116/h26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H,29-30,33-46H2,1-25H3,(H2,93,117)(H2,94,118)(H,95,132)(H,96,133)(H,97,134)(H ,98,124)(H,99,119)(H,100,122)(H,101,125)(H,102,135)(H,103,128)(H,104,136)(H,105,116)(H,106,123)(H,107,126)(H ,108,127)(H,109,129)(H,110,131)(H,111,130)(H,112,137)(H,120,121)/t50-,51-,54-,55-,56-,57-,58-, 59-,60-,65-,66-/m0/s1 Oui Clé : LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNSA-N Oui InChI=1/C92H150N22O25/c1-47(2)43-58(72(127)108-92(24,25)84(139)113-41-29-33-59(113)73(128)103- 65(48(3)4)75(130)111-90(20,21)82(137)112-89(18,19)80(135)102-56(37-40-64(120)121) 70(125)101-55(35-38-61(93)117)69(124)98-54(46-115)44-53-31-27-26-28-32-53)99-63( 119)45-95-77(132)85(10,11)110-76(131)66(49(5)6)104-81(136)88(16,17)107-71(126)57( 36-39-62(94)118)100-67(122)50(7)96-78(133)86(12,13)106-68(123)51(8)97-79(134)87( 14,15)109-74(129)60-34-30-42-114(60)83(138)91(22,23)105-52(9)116/h26-28,31-32,47- 51,54-60,65-66,115H,29-30,33-46H2,1-25H3,(H2,93,117)(H2,94,118)(H,95,132)(H,96,133)(H,97,134)(H ,98,124)(H,99,119)(H,100,122)(H,101,125)(H,102,135)(H,103,128)(H,104,136)(H,105,116)(H,106,123)(H,107,126)(H ,108,127)(H,109,129)(H,110,131)(H,111,130)(H,112,137)(H,120,121)/t50-,51-,54-,55-,56-,57-,58-, 59-,60-,65-,66-/m0/s1 Clé : LGHSQOCGTJHDIL-UTXLBGCNBC
SOURIRE CC(C)C[C@@H](C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C( C)C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)NC(C)(C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C( =O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)CO)NC(=O)CNC(=O )C(C)(C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)[C@H](CCC( =O)N)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)C( C)(C)NC(=O)[C@@H]3CCCN3C(=O)C(C)(C)NC(=O)C CC(C)CC(C(=O)NC(C)(C)C(=O)N1CCCC1C(=O)NC(C(C)C)C(=O)NC(C)(C)C( =O)NC(C)(C)C(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)NC(CCC(=O)N)C(=O)NC(Cc2ccccc2)CO)NC (=O)CNC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(CCC( =O)N)NC(=O)C(C)NC(=O)C(C)(C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(C)(C)NC(= O)C3CCCN3C(=O)C(C)(C)NC(=O)C
Propriétés
Formule chimique	C 92 H 150 N 22 O 25
Masse molaire	1964,31 g/mol
Apparence	Solide blanc cassé
Point de fusion	255 à 270 °C (491 à 518 °F ; 528 à 543 K)
solubilité dans l'eau	Insoluble
Solubilité dans DMSO , méthanol , éthanol	Soluble
Sauf indication contraire, les données sont données pour les matériaux dans leur état standard (à 25 °C [77 °F], 100 kPa).
N vérifier  ( qu'est-ce que c'est   ?) OuiN
Références de l'infobox

L' alaméthicine est un antibiotique peptidique formant des canaux , produit par le champignon Trichoderma viride . Il appartient aux peptides peptaibol qui contiennent le résidu d'acide aminé non protéinogène Aib ( acide 2-aminoisobutyrique ). Ce résidu induit fortement la formation d' une structure en hélice alpha . La séquence peptidique est :

Ac-Aib-Pro-Aib-Ala-Aib-Ala-Gln-Aib-Val-Aib-Gly-Leu-Aib-Pro-Val-Aib-Aib-Glu-Gln-Phl

(Ac = acétyle, Phl = phénylalaninol , Aib = acide 2-aminoisobutyrique )

Dans les membranes cellulaires , il forme des canaux ioniques voltage- dépendants par agrégation de quatre à six molécules .

Biosynthèse

La biosynthèse de l'alaméthicine est supposée être catalysée par l'alaméthicine synthase, une peptide synthase non ribosomique (NRPS) isolée pour la première fois en 1975. Bien qu'il existe plusieurs séquences du peptide alaméthicine acceptées, les preuves suggèrent qu'elles suivent toutes le mécanisme général de la NRPS avec de petites variations au niveau des acides aminés sélectionnés. . Commençant par l' acylation de l'extrémité N terminale du premier acide aminoisobutirique sur l'enzyme ALM synthase par l' acétyl-CoA , elle est suivie de la condensation séquentielle des acides aminés par chaque unité modulaire de la synthétase. Les acides aminés sont initialement adénylés par un domaine « d' adénylylation » (A) avant d'être attachés par une liaison thioester à une protéine porteuse peptidique de type Acyl Carrier Protein . La chaîne en croissance est attachée à l'acide aminé portant PCP par le domaine de "condensation" (C), suivi d'un autre cycle des mêmes réactions par le module suivant.

Le mécanisme général de la synthèse de NRPS dans l'alaméthicine, montrant la condensation de substrats d'acides aminés de module en module. Ac=acétyl Aib=acide aminoisobutyrique. Composants du module : A= Adénylylation PCP= Peptidyl Carrier Protein C=Condensation

L'assemblage est complété par l'ajout de phénylalaninol, un substrat inhabituel semblable à un acide aminé. Après l'ajout de phénylalaninol, la chaîne peptidique complète est clivée par le domaine thioestérase, clivant la liaison thioester et laissant un alcool.

Un diagramme des modules individuels et de l'allongement de la biosynthèse de l'alaméthicine. La chaîne peptidique en croissance est indiquée pour chaque module, se terminant par le clivage du thioester et la génération d'alaméthicine linéaire. Ac=Acétyl Aib=Acide aminoisobutyrique Pheol=Phénylalaninol. Composants du module : A=Adénylylation PCP=Peptidyl Carrier Protein C=Condensation

Les références

Lectures complémentaires

• Jones, LR; Maddock, sud-ouest ; Besch, HR Jr (1980). "Démasquage de l'effet de l'alaméthicine sur la (Na+,K+)-ATPase, l'adénylate cyclase couplée aux récepteurs bêta-adrénergiques et les activités de protéine kinase dépendante de l'AMPc des vésicules cardiaques du sarcolemme" . J. Biol. Chem . 255 (20) : 9971–9980. doi : 10.1016/S0021-9258 (18) 43488-6 . PMID  6253461 .
• Explorez les structures de l' alamethicine à la banque de données sur les protéines
• Alamethicine dans Norine
  • De "Un modèle de canal ionique voltage-dépendant déduit de la structure cristalline de l'alaméthicine à une résolution de 1,5 A." Fox Jr, RO ; Richards, FM (1982). « Un modèle de canal ionique voltage-dépendant déduit de la structure cristalline de l'alaméthicine à une résolution de 1,5 A ». Nature . 300 (5890) : 325-30. Bibcode : 1982Natur.300..325F . doi : 10.1038/300325a0 . PMID  6292726 . S2CID  4278453 .
• Leitgeb, Balázs; Szekeres, Andras; Manczinger, Lászlo ; Vágvölgyi, Csaba; Kredics, László (2007-06-01). "L'histoire d'Alamethicin : Une revue du Peptaibol le plus largement étudié". Chimie & Biodiversité . 4 (6) : 1027-1051. doi : 10.1002/cbdv.200790095 . ISSN  1612-1880 . PMID  17589875 . S2CID  40886688 .