Suppression (génétique) - Deletion (genetics)

Suppression sur un chromosome

En génétique , une deletion (appelé aussi la suppression de gène , une carence ou une mutation de deletion ) (signe: Δ ) est une mutation (une aberration génétique) , dans laquelle une partie d'un chromosome ou d' une séquence d' ADN est omis lors de la réplication de l' ADN. N'importe quel nombre de nucléotides peut être supprimé, d'une seule base à un morceau entier de chromosome.

Les plus petites mutations par délétion d'une seule base se produisent par un basculement d'une seule base dans l'ADN matrice, suivi d'un glissement de brin d'ADN matrice, dans le site actif de l'ADN polymérase.

Les délétions peuvent être causées par des erreurs de croisement chromosomique pendant la méiose , ce qui provoque plusieurs maladies génétiques graves . Les suppressions qui ne se produisent pas dans des multiples de trois bases peuvent provoquer un décalage du cadre de lecture en modifiant le cadre de lecture de la protéine à 3 nucléotides de la séquence génétique. Les délétions sont représentatives des organismes eucaryotes , y compris les humains et non des organismes procaryotes , tels que les bactéries.

Causes

Les causes incluent les suivantes :

Pour qu'une synapse se produise entre un chromosome présentant un déficit intercalaire important et un homologue complet normal, la région non appariée de l'homologue normal doit sortir de la structure linéaire en une boucle de délétion ou de compensation .

Les types

Les types de suppression sont les suivants :

  • Délétion terminale - une délétion qui se produit vers la fin d'un chromosome.
  • Délétion intercalaire/interstitielle – une délétion qui se produit à l'intérieur d'un chromosome.
  • Microdélétion – une quantité relativement faible de délétion (jusqu'à 5 Mo pouvant inclure une douzaine de gènes).

La micro-délétion est généralement observée chez les enfants présentant des anomalies physiques. Une grande quantité de suppression entraînerait un avortement immédiat (fausse couche).

Effets

Les petites délétions sont moins susceptibles d'être fatales ; les délétions importantes sont généralement fatales – il y a toujours des variations en fonction des gènes perdus. Certaines délétions de taille moyenne conduisent à des troubles humains reconnaissables, par exemple le syndrome de Williams .

La suppression d'un nombre de paires inégalement divisibles par trois entraînera une mutation par décalage du cadre de lecture , provoquant une lecture incorrecte de tous les codons apparaissant après la suppression pendant la traduction , produisant une protéine gravement altérée et potentiellement non fonctionnelle . En revanche, une suppression qui est divisible par trois est appelée suppression dans le cadre .

Les délétions sont responsables d'un éventail de troubles génétiques, dont certains cas d' infertilité masculine , les deux tiers des cas de dystrophie musculaire de Duchenne et les deux tiers des cas de mucoviscidose (ceux causés par ΔF508 ). La suppression d'une partie du bras court du chromosome 5 entraîne le syndrome de Cri du chat . Les délétions du gène codant pour le SMN provoquent une atrophie musculaire spinale , la cause génétique la plus courante de décès infantile.

Des travaux récents suggèrent que certaines délétions de séquences hautement conservées (CONDEL) peuvent être responsables des différences évolutives présentes parmi les espèces étroitement apparentées. De telles délétions chez l'homme, appelées hCONDEL , peuvent être responsables des différences anatomiques et comportementales entre les humains, les chimpanzés et d'autres variétés de mammifères comme les grands singes ou les singes.

Détection

L'introduction de techniques moléculaires en conjonction avec des méthodes cytogénétiques classiques a considérablement amélioré ces dernières années le potentiel de diagnostic des anomalies chromosomiques. En particulier, l'hybridation génomique comparative microarray (CGH) basée sur l'utilisation de clones BAC promet une stratégie sensible pour la détection des changements de nombre de copies d'ADN à l'échelle du génome. La résolution de détection pourrait atteindre plus de 30 000 « bandes » et la taille de la délétion chromosomique détectée pourrait atteindre une longueur de 5 à 20 kb. D'autres méthodes de calcul ont été sélectionnées pour découvrir les erreurs de suppression du séquençage de l'ADN telles que le profilage de la séquence finale .

Voir également

Les références