Haplogroupe J (ADNmt) - Haplogroup J (mtDNA)
Haplogroupe J | |
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Heure d'origine possible | 45 000 ans avant le présent |
Lieu d'origine possible | Asie occidentale |
Ancêtre | JT |
Descendance | J1, J2 |
Définition des mutations | 295 489 10398 12612 13708 16069 |
Haplogroup J est un ADN mitochondrial humain (ADNmt) haplogroup . Les dérive clade du JT haplogroupe , qui a également donné lieu à l' haplogroupe T . Dans son livre The Seven Daughters of Eve , Bryan Sykes a nommé l'initiateur de cet haplogroupe d'ADNmt Jasmine . Dans le domaine de la génétique médicale , certains polymorphismes spécifiques de l'haplogroupe J ont été associés à la neuropathie optique héréditaire de Leber .
Origine
Environ 45 000 ans avant le présent, une mutation a eu lieu dans l'ADN d'une femme qui vivait au Proche-Orient ou dans le Caucase . D'autres mutations se sont produites dans la lignée J, qui peuvent être identifiées comme les sous-clades J1a1, J1c1 (il y a 27 000 ans), J2a (il y a 19 000 ans), J2b2 (il y a 16 000 ans) et J2b3 (il y a 5 800 ans). Les porteurs de l'haplogroupe J ainsi que les personnes portant le clade ADNmt T se sont installés en Europe depuis le Proche-Orient à la fin du Paléolithique et du Mésolithique .
Sous-clade | Temps de coalescence européen | Temps de coalescence au Proche-Orient |
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J1a1 | 27 300 ans ( ± 8 000 ans) | 17 700 ans ( ± 2 500 ans) |
J1a2 | 7 700 ans ( ± 3 500 ans) | - |
J1b | 5 000 ans ( ± 2 200 ans) | 23 300 ans ( ± 4 300 ans) |
J2a | 19 200 ans ( ± 6 900 ans) | - |
J2b1 | - | 15 000 ans ( ± 5 000 ans) |
J2b2 | 16 600* ans ( ± 8 100 ans) | 16 000 ans ( ± 5 700 ans) |
J2b3 | 5 800 ans ( ± 2 900 ans) | - |
* L' erreur typographique était de 161 600 ans à partir du matériel source original selon le tableau chronologique décrivant la répartition des populations donnée dans la même étude.
Cependant, toute déclaration concernant l'origine géographique de cet haplogroupe ou de tout autre haplogroupe est hautement spéculative et considérée par la plupart des généticiens des populations comme un « récit » et hors du domaine de la science . De plus, déduire des associations étroites entre un haplogroupe et une culture archéologique spécifique peut être tout aussi problématique.
Sous-clade Affectation alphanumérique | Âge calculé via le ratio de propagation empirique et de taux de dérive mutationnelle IC = 95 % |
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J2 | 28 259,7 ± 4 605,0 (Entre 23 700 et 32 900 ans) |
J2a | 24 051,5 ± 4 183,2 (Entre 19 900 et 28 200 ans) |
J2a1 | 21 186,1 ± 4 485,5 (Entre 16 700 et 25 700 ans) |
J2a1a | 12 986,1 ± 4 077,7 (Entre 8 900 et 17 100 ans) |
J2a1a1 | 8 949,8 ± 3 051,3 (entre 5 900 et 12 000 ans) |
J2a1a1a | 7 591,6 ± 2 889,6 (entre 4 700 et 10 500 ans) |
J2a1a1a2 | 3 618,9 ± 2 973,9 (Entre 600 et 6 600 ans) |
Distribution
L'haplogroupe basal J* se trouve chez les Soqotri (9,2%).
La fréquence moyenne de l'haplogroupe J dans son ensemble est aujourd'hui la plus élevée au Proche-Orient (12 %), suivi par l'Europe (11 %), le Caucase (8 %) et l'Afrique du Nord-Est (6 %). Sur les deux principaux sous-groupes, J1 occupe les quatre cinquièmes du total et est largement répandu sur le continent tandis que J2 est plus localisé autour de la Méditerranée, de la Grèce, de l'Italie/Sardaigne et de l'Espagne.
Il existe également des preuves limitées que la sous-clade J1 est présente depuis longtemps en Asie centrale . Par exemple, l'incidence la plus élevée de l'haplogroupe J est peut-être les 19% de Roms polonais , qui appartiennent à J1 (bien que cela ait également été attribué à un « effet fondateur » d'une certaine sorte). Au Pakistan, où les lignées d'Eurasie occidentale se produisent à des fréquences allant jusqu'à 50 % dans certains groupes ethnolinguistiques, l'incidence de J1 est en moyenne d'environ 5 %, tandis que J2 est très rare. Cependant, J2 se trouve parmi 9% de la minorité Kalash du nord-ouest du Pakistan .
Dans la péninsule arabique, l'haplogroupe J de l'ADNmt se trouve chez les Saoudiens (10,5 à 18,8 % J1b) et les Yéménites (0 à 20 % J1b). La sous-clade J1b est également présente au Proche-Orient chez les Irakiens (7,1 %) et les Palestiniens (4 %).
En Afrique, l'haplogroupe J est concentré dans le nord-est. On le trouve chez les Algériens (3,23-14,52%), ainsi que les Coptes soudanais (10,3% J1a ; 10,3% J2), les Peuls soudanais (10,7% J1b), Meseria (6,7% J1b), Arakien (5,9% J1b), les Égyptiens (5,9 %), les Berbères mozabites (3,53 %), les Hausa soudanais (2,9 % J1b), les Berbères Zenata (2,74 %), les Beja (2,1 % J1b) et les Sahraouis Reguibate (0,93 %).
En Europe, la distribution de fréquence >2 % de l'ADNmt J est la suivante :
- J* = Irlande — 12 %, Angleterre-Pays de Galles — 11 %, Écosse — 9 %, Orcades — 8 %, Allemagne — 7 %, Russie (européenne) — 7 %, Islande — 7 %, Autriche-Suisse — 5 %, Finlande-Estonie — 5%, Espagne-Portugal — 4%, France-Italie — 3%
- J1a = Autriche-Suisse — 3%
- J1b1 = Écosse — 4%
- J2 = France-Italie — 2%
- J2a = Réparti de manière homogène en Europe ; absent dans les nations autour du Caucase; pas connu pour être trouvé ailleurs.
- J2b1 = Pratiquement absent en Europe ; présente sous diverses formes au Proche-Orient.
- J2b1a = Trouvé en Europe occidentale et en Russie.
L'haplogroupe J a également été trouvé parmi les momies égyptiennes anciennes fouillées sur le site archéologique d' Abousir el-Meleq en Moyenne Égypte, qui datent des périodes pré-ptolémaïque/fin du Nouvel Empire , ptolémaïque et romaine . L'haplogroupe J a été observé dans d'anciens fossiles de Guanche excavés à Gran Canaria et à Tenerife sur les îles Canaries , qui ont été datés au dardiocarbone entre le 7e et le 11e siècle de notre ère. Tous les individus porteurs du clade ont été inhumés sur le site de Tenerife, avec un spécimen appartenant à la sous-clade J1c3 (1/7 ; ~ 14 %). Le clade J a également été retrouvé parmi des spécimens ibéromaurusiens datant de l' Épipaléolithique sur le site préhistorique d' Afalou . Environ 22% des haplotypes observés appartenaient à diverses sous-clades J, y compris J indifférencié (1/9 ; 11%) et J1c3f (1/9 ; 11%).
En Sibérie orientale, l'haplogroupe J1c5 a été observé dans des échantillons de Yakoutes (3/111 = 2,7% Vilyuy Yakut, 2/148 = 1,4% Yakut du Nord, 1/88 = 1,1% Yakut central, 1/164 = 0,6% Yakut central) , Evenks en Yakoutie (4/125 = 3,2%) et Evens en Yakoutie (1/105 = 1,0%). L'haplogroupe J2a2b3 a été observé dans un échantillon de Nyukzha Evenks (2/46 = 4,3%). L'haplogroupe J2 a également été observé dans un échantillon d'Evenks collectés dans le district d'Olenyoksky, le district de Zhigansky et le district d'Ust-Maysky en Yakoutie (7/125 = 5,6 %). Un exemple de l'haplogroupe J1c10a1 a été observé dans l' échantillon du Human Genome Diversity Project de dix individus Oroqen de l'extrême nord de la Chine .
Sous-clades
Arbre
Cet arbre phylogénétique des sous-clades de l'haplogroupe J est basé sur l'article de Mannis van Oven et Manfred Kayser Arbre phylogénétique complet mis à jour de la variation mondiale de l'ADN mitochondrial humain et des recherches publiées ultérieures.
Arbre P ADNmt HG "J" |
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Traits génétiques
Il a été théorisé que le découplage de la phosphorylation oxydative liée aux SNP qui définissent le mt-haplogroupe J produit par conséquent une chaleur corporelle plus élevée dans le phénotype des individus ADNmt J. Cela a été lié à une pression sélective pour la présence de l'haplogroupe en Europe du Nord, en particulier en Norvège. Les individus des haplogroupes Uk, J1c et J2 se sont révélés plus sensibles à la neuropathie optique héréditaire de Leber, car ils ont une capacité de phosphorylation oxydative réduite, qui résulte en partie de niveaux d'ADNmt plus faibles. L'ADNmt J a également été associé à des individus infectés par le VIH présentant une progression accélérée vers le SIDA et la mort. La mutation T150C, qui est exclusive mais non définitive, de la sous-clade J2 de l'haplogroupe J peut faire partie d'un mécanisme général probablement contrôlé par le noyau concernant le remodelage et la réplication de l'ADNmt. Contrôler un remodelage qui pourrait accélérer la réplication de l'ADNmt compensant ainsi les dommages oxydatifs de l'ADNmt ainsi que la détérioration fonctionnelle survenant avec la vieillesse qui lui est liée. L'haplogroupe J s'est avéré être un facteur protecteur contre la cardiomyopathie ischémique . Il a également été constaté que l'haplogroupe J était un facteur de protection chez les patients souffrant d'arthrose d'Espagne mais pas du Royaume-Uni, et cela a été supposé être dû à une composition génétique différente (polymorphismes) de l'haplogroupe J dans les deux populations. Une étude portant sur des patients d'origine ou d'origine européenne et asiatique occidentale a montré que les individus classés comme haplogroupe J ou K présentaient une diminution significative du risque de maladie de Parkinson par rapport aux individus porteurs de l'haplogroupe le plus courant, H.
La culture populaire
- L'ADNm de Mario Batali est J1.
- Ximena Navarrete Miss Univers 2010, est l'haplogroupe J. Quo , un magazine de pop-science , déclare que son haplogroupe a survécu à la glaciation quaternaire , dont les individus ont été protégés des intempéries dans la région franco-cantabrique dans le nord de l'Espagne et le sud-ouest de la France.
- Richard III d'Angleterre avait l'haplogroupe d'ADNmt J1c2c3.
- dans le livre de Bryan Sykes The Seven Daughters of Eve , l'haplogroupe J est appelé « Clan Jasmine ».
Voir également
- Test ADN généalogique
- Généalogie génétique
- Génétique mitochondriale humaine
- Génétique des populations
Arbre phylogénétique des haplogroupes de l'ADN mitochondrial humain (ADNmt) |
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Eve mitochondriale ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | ré | E | g | Q | O | UNE | S | R | je | W | X | Oui | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | pré-JT | P | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HT | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | V | J | T |
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Liens externes
- Général
- Site d'ADN mitochondrial de Ian Logan
- De Mannis van Oven Phylotree
- Haplogroupe J
- Arbre 2009 mt-Haplogroupe J de Jim Logan des sous-clades et des branches par mutation
- Une analyse complète de l'haplogroupe J de l'ADNmt (Jim Logan. Septembre 2008)
- Une phylogénie raffinée pour l'haplogroupe J de l'ADNmt
- Les sous-clades de l'haplogroupe J d'ADNmt et les motifs proposés pour l'attribution de séquences de région de contrôle à ces clades
- Carte du mtHaplogroupe J. (Légendes en russe/cyrillique)
- J (& sous-clades) projet mt-Haplogroup à FTDNA
-
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- JmtDNA Yahoo Group Téléchargement de fichiers