Helen M. Berman - Helen M. Berman
Helen Berman | |
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 Helen Berman en 2008.
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| Née |
Helen Miriam Berman
1943 (77 à 78 ans) Chicago, Illinois
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| mère nourricière | |
| Conjoint (s) | |
| Enfants | Jason Asher Young |
| Récompenses | |
| Carrière scientifique | |
| Des champs | |
| Les institutions | Université Rutgers |
| Thèse | Les structures cristallines de l'Alpha Prime et du Bêta-D-Mannitol, du Galacticol, du Méthyl Aalpha-D-Glucopyranoside et de l'Hydroxyurée (1967) |
| Conseiller doctoral | George A. Jeffrey |
| Autres conseillers académiques | Barbara Low , Jenny Glusker |
| Site Internet | rutchem |
Helen Miriam Berman est professeure au Conseil des gouverneurs de chimie et de biologie chimique à l'Université Rutgers et ancienne directrice de la RCSB Protein Data Bank (l'une des organisations membres de la Worldwide Protein Data Bank ). Biologiste structurale, son travail comprend l'analyse structurale des complexes protéines-acides nucléiques et le rôle de l'eau dans les interactions moléculaires. Elle est également la fondatrice et la directrice de la base de données sur les acides nucléiques et a dirigé la base de connaissances de la génomique structurelle de la Protein Structure Initiative.
Contexte et formation
Berman est né à Chicago, Illinois, et a grandi à Brooklyn, New York. Son père, David Bernstein, était médecin et sa mère, Dorothy Bernstein (née Skupsky), dirigeait le cabinet de son père. Inspirée par son père travailleur et érudit, elle s'intéressait à la science en tant que jeune fille et envisageait de devenir scientifique ou médecin. Sa mère, qui était fortement impliquée dans la communauté et le travail bénévole, l'a incitée à s'impliquer dans des activités communautaires tout au long de sa vie.
Au lycée, Berman a travaillé dans le laboratoire d'Ingrith Deyrup au Barnard College . Deyrup a encouragé Berman à fréquenter Barnard en tant qu'étudiant de premier cycle. Pendant ses études universitaires, elle a travaillé dans un laboratoire du Collège des médecins et chirurgiens de l'Université Columbia avec Barbara Low . Là, Berman a appris la cristallographie , qui allait devenir une passion de toute une vie. Elle est diplômée de Barnard avec un AB en chimie en 1964.
Après l'université, Berman a fréquenté l' Université de Pittsburgh pour des études supérieures, un endroit qu'elle a choisi parce que c'était le seul endroit du pays avec un département de cristallographie et l'un des rares où la cristallographie était proposée comme matière. Là, elle a travaillé avec George A. Jeffrey sur la structure des glucides, recevant son doctorat. en 1967. Berman est resté à l'Université de Pittsburgh pendant encore deux ans en tant que chercheur postdoctoral .
Carrière
En 1969, Berman a déménagé au Fox Chase Cancer Center de Philadelphie, où elle a travaillé dans le laboratoire de Jenny P. Glusker avant de lancer son propre programme de recherche indépendant en tant que membre du corps professoral en 1973. À Fox Chase, Berman s'est intéressée aux structures d'acide nucléique. et en bioinformatique. Elle savait que l'organisation logique des données les rendrait utiles à divers scientifiques.
En juin 1971, Berman a participé à un symposium au Cold Spring Harbor Laboratory , où plusieurs scientifiques ont convenu que les données sur le nombre croissant de structures protéiques devraient être archivées dans une base de données. Cette réunion a conduit à la création de la Protein Data Bank (PDB) au Brookhaven National Laboratory .
En 1989, Berman a déménagé à Rutgers et en 1992, avec d'autres scientifiques, elle a cofondé la base de données sur les acides nucléiques (NDB) pour collecter et diffuser des informations sur la structure des acides nucléiques. Chez Rutgers, elle a continué à étudier les acides nucléiques, leurs interactions avec les protéines, et a également étudié la structure du collagène en collaboration avec Barbara Brodsky et Jordi Bella. Elle est répertoriée comme déposante sur 38 structures de la PDB de 1992 à 2011, de complexes protéines / acides nucléiques et leurs composants (ex. 1RUN, 3SSX, 2B1B), de fragments de collagène (ex. 1CGD, 1EI8) et d'autres macromolécules.
En 1998, Berman et Philip Bourne ont concouru et remporté le contrat pour la Protein Data Bank et la base de données a été transférée de Brookhaven sous les auspices du Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB), actuellement une collaboration entre Rutgers et l'Université de Californie, San Diego. Avec ses collègues, Berman a repensé le système de gestion des données, ajouté de nouveaux outils utilisateur et rendu la base de données consultable. Depuis 2003, les archives PDB sont gérées par la banque mondiale de données sur les protéines (wwPDB), un partenariat fondé par Berman qui se compose d'organisations qui agissent en tant que centres de dépôt, de traitement et de distribution des données PDB - le RCSB, le PDBe en Europe, et le PDBj au Japon. En 2006, la banque de données BioMagResData (BMRB) pour les structures de résonance magnétique nucléaire (RMN) est devenue le quatrième membre du wwPDB. En juillet 2018, le NDB contient plus de 9600 structures d'acide nucléique et le PDB plus de 142000 structures macromoléculaires.
Également dirigée par le RCSB, la base de connaissances sur la génomique structurelle de l'Initiative sur la structure des protéines (PSI) a été lancée au printemps 2008 pour fournir un portail mis à jour en permanence vers les données de recherche et d'autres ressources issues des efforts du PSI.
Berman a également été actif dans la communauté scientifique, en tant que président de l'American Crystallographic Association en 1988, en conseillant à la fois les National Institutes of Health et la National Science Foundation, et siégeant au comité de rédaction de plusieurs revues. Ses travaux ont été largement publiés dans des revues scientifiques à comité de lecture .
Berman a été le producteur exécutif et créateur de la série documentaire Target Zero qui se concentre sur les aspects médicaux et sociaux du traitement et de la prévention du VIH. Les trois courts métrages mêlent des histoires de patients réels, des entretiens avec des médecins, des prestataires médicaux et des scientifiques de premier plan; et des animations moléculaires de pointe. Ces récits éclairent l'histoire complexe du contrôle de l'épidémie de VIH et révèlent le besoin permanent de soins compatissants et centrés sur le patient et d'une véritable compréhension au niveau cellulaire de la science derrière les traitements.
Honneurs et récompenses
- New Jersey Woman of Achievement (1993)
- Membre, Association américaine pour l'avancement des sciences (1996)
- Prix de femme scientifique exceptionnelle, Association for Women in Science , chapitre de New York (1999)
- Professeur émérite, Sigma Xi : The Scientific Research Society (2007–2009)
- Distinguished Service Award, Biophysical Society (2000) [1]
- Fellow, Société de biophysique (2001)
- Prix MJ Buerger, American Crystallographic Association (2006)
- Prix des anciens du Département de chimie de l'Université de Pittsburgh (2010)
- Fellow de l'American Crystallographic Association (2011) [2]
- Prix Carl Brändén de la Protein Society (2012)
- Prix DeLano pour les biosciences computationnelles de l'American Society for Biochemistry and Molecular Biology (2013)
- Prix Benjamin Franklin pour le libre accès dans les sciences de la vie (2014)
Vie privée
Berman a été mariée deux fois avec l'ingénieur Victor Berman dans les années 1960 et avec le biologiste moléculaire Peter Young de 1976 à 1999. Du deuxième mariage, elle a un fils, Jason Asher Young (né en 1979), physicien.
Au cours des années 1980, Berman a reçu un diagnostic de cancer du sein. L'expérience l'a amenée à se concentrer davantage sur sa vie et sa carrière et à soutenir d'autres femmes confrontées au même diagnostic.