Mimiviridae -Mimiviridae

Mimiviridae
Tupanvirus.jpeg
Tupanvirus
Classification des virus e
(non classé): Virus
Royaume : Varidnavirie
Royaume: Bamfordvirae
Phylum: Nucleocytoviricota
Classer: Mégaviricètes
Commander: Imitervirales
Famille: Mimiviridae
Sous-familles et genres

Les Mimiviridae sont une famille de virus . Les amibes et autres protistes servent d'hôtes naturels. La famille est divisée en jusqu'à 4 sous-familles. Les virus de cette famille appartiennent auclade des virus nucléocytoplasmiques à grand ADN (NCLDV), également appelés virus géants .

Les Mimiviridae sont le seul membre reconnu de l'ordre des Imitervirales . Les Phycodnaviridae et les Pandoraviridae des Algavirales sont des groupes frères des Mimiviridae dans de nombreuses analyses phylogénétiques.

Histoire

Le premier membre de cette famille, Mimivirus, a été découvert en 2003, et la première séquence complète du génome a été publiée en 2004. Cependant, le virus mimivirus Cafeteria roenbergensis a été isolé et partiellement caractérisé en 1995, bien que l'hôte ait été mal identifié à l'époque, et le virus a été désigné BV-PW1.

Taxonomie

Groupe : ADNdb

Ordre : Imitervirales

La famille des Mimiviridae est actuellement divisée en trois sous-familles.

  • Une sous-famille (genre Mimivirus , noms proposés : Megavirinae ou Megamimivirinae ) est divisée en trois « lignées » :
    • A — Groupe Mimivirus : comprend Acanthamoeba polyphaga Mimivirus , Hirudovirus, Mamavirus , virus Kroon, virus Lentille , Terra2, virus Niemeyer, virus Samba.
    • B — Groupe Moumouvirus : comprend le Moumouvirus , le Moumouvirus saoudien, le Moumouvirus goulette , le virus Monve (alias Moumouvirus monve) et le virus Ochan .
    • C — Groupe de virus Courdo11 : comprend Mont1 , Courdo7, Courdo11, Megavirus chilensis, LBA111, Powai lake megavirus et Terra1.
La majorité des Mimiviridae semblent appartenir à cette sous-famille (Mimivirus).
Il est parfois aussi appelé Mimiviridae groupe I.

En outre, il a été proposé soit d'étendre les Mimiviridae par un groupe provisoire supplémentaire III (sous-famille des Mesomimivirinae ), soit de classer ce groupe comme une famille sœur des Mesomimiviridae à la place, comprenant l'héritage OLPG (Organic Lake Phycodna Group). Cette extension (ou famille sœur) peut être constituée des éléments suivants :

Ce groupe semble être étroitement lié aux Mimiviridae plutôt qu'aux Phycodnaviridae et est donc parfois désigné comme une autre sous-famille candidate Mesomimivirinae . Parfois, la famille élargie des Mimiviridae est appelée Megaviridae bien que cela n'ait pas été reconnu par ICTV ; alternativement, le groupe étendu peut être appelé simplement Mimiviridae .

Avec la reconnaissance du nouvel ordre Imitervirales par l'ICTV en mars 2020, il n'est plus nécessaire d'étendre la famille des Mimiviridae pour comprendre un groupe de virus de la grande diversité observée. Au lieu de cela, l'extension (ou au moins son clade principal ) peut être appelée famille sœur des Mesomimiviridae .

Bien que seuls quelques membres de cet ordre aient été décrits en détail, il semble probable qu'il y en ait beaucoup plus en attente de description et d'affectation. Les membres non affectés incluent le virus Aureococcus anophagefferens (AaV), CpV-BQ2 et Terra2.

Structure

Ultrastructure des particules du virus Bodo saltans et sa réplication

Les virus des Mimiviridae ont des géométries icosaédriques et rondes, avec une symétrie comprise entre T=972 et T=1141, ou T=1200. Le diamètre est d'environ 400 nm, avec une longueur de 125 nm. Les génomes sont linéaires et non segmentés, d'une longueur d'environ 1200 Ko. Le génome a 911 cadres de lecture ouverts.


Genre Structure Symétrie Arrangement génomique Segmentation génomique
Mimivirus Icosaédrique T=972-1141 ou T=1200 (H=19 +/- 1, K=19 +/- 1) Linéaire Monopartite
Klosneuvirus Icosaédrique
Virus de la cafétéria Icosaédrique T=499 Linéaire Monopartite
Tupanvirus Queue

Cycle de la vie

La réplication suit le modèle de déplacement de brin d'ADN. La transcription sur matrice d'ADN est la méthode de transcription. L'amibe sert d'hôte naturel.

Genre Détails de l'hôte Tropisme tissulaire Détails de l'entrée Détails de la version Site de réplication Site de montage Transmission
Mimivirus Amibe Rien Inconnu Inconnu Inconnu Inconnu Diffusion passive
Klosneuvirus microzooplancton Rien Inconnu Inconnu Inconnu Cytoplasme Diffusion passive
Virus de la cafétéria microzooplancton Rien Inconnu Inconnu Inconnu Cytoplasme Diffusion passive

Biologie moléculaire

Dans le génome du virus Lentille, le génome intégré d'un virophage (Sputnik 2) et d'un transpoviron - un élément génétique mobile - a été signalé. Les transpovirons sont des éléments d'ADN linéaires d'environ 7 kilobases qui englobent six à huit gènes codant pour des protéines, dont deux sont homologues aux gènes des virophages. Le large spectre du virophage mimiviridae permet son isolement à l'aide d'un rapporteur mimivirus.

Clinique

Les mimivirus ont été associés à la pneumonie, mais leur signification est actuellement inconnue. Le seul virus de cette famille isolé à ce jour chez l'homme est le LBA 111. À l'Institut Pasteur d'Iran (Téhéran), les chercheurs ont identifié l'ADN de mimivirus dans des échantillons de lavage broncho-alvéolaire (LBA) et d'expectorations d'un enfant patient, en utilisant la PCR en temps réel ( 2018). L'analyse a rapporté 99 % d'homologie de LBA111, lignée C du Megavirus chilensis . Avec seulement quelques cas signalés avant cette découverte, la légitimité du mimivirus en tant que maladie infectieuse émergente chez l'homme reste controversée.

Le mimivirus a également été impliqué dans la polyarthrite rhumatoïde .

Voir également

Les références

Liens externes