Paléovirologie - Paleovirology
La paléovirologie est l'étude de virus qui existaient dans le passé mais qui sont aujourd'hui éteints. En général, les virus ne peuvent pas laisser de fossiles physiques, c'est pourquoi des preuves indirectes sont utilisées pour reconstruire le passé. Par exemple, les virus peuvent provoquer une évolution de leurs hôtes, et les signatures de cette évolution peuvent être trouvées et interprétées de nos jours. En outre, certains fragments génétiques viraux qui ont été intégrés dans les cellules germinales d'un organisme ancien ont été transmis à notre époque sous forme de fossiles viraux ou d' éléments viraux endogènes (EVE). Les EVE qui proviennent de l'intégration de rétrovirus sont connus sous le nom de rétrovirus endogènes , ou ERV, et la plupart des fossiles viraux sont des ERV. Ils peuvent préserver le code génétique d'il y a des millions d'années, d'où la terminologie «fossile», bien que personne n'ait détecté de virus dans les fossiles minéraux . Les fossiles viraux les plus surprenants proviennent de virus à ADN et ARN non rétroviraux .
Terminologie
Bien qu'il n'y ait pas de système de classification formel pour les EVE, ils sont classés en fonction de la taxonomie de leur origine virale. En effet, tous les types de génome viral et stratégies de réplication connus, tels que définis par la classification de Baltimore , ont été trouvés dans les archives génomiques fossiles. Des acronymes ont été désignés pour décrire différents types de fossiles viraux.
- EVE: élément viral endogène
- ERV: rétrovirus endogène
- HERV: rétrovirus endogène humain
- NIRV: Les fossiles viraux provenant de virus à ARN non rétroviraux ont été appelés virus à ARN intégrés non rétroviraux ou NIRV. Contrairement à d'autres types de fossiles viraux, la formation de NIRV nécessite l'emprunt de la machinerie d'intégration qui est codée par le génome de l'hôte ou par un rétrovirus co-infectant.
D'autres fossiles viraux proviennent de virus à ADN tels que les hépadnavirus (un groupe qui comprend l' hépatite B ).
Résurrection
Des tentatives réussies de «ressusciter» des virus éteints à partir des fossiles d'ADN ont été signalées. En outre, Pithovirus sibericum a été ressuscité à partir d'une carotte de glace vieille de 30 000 ans récoltée dans le pergélisol en Sibérie , en Russie.
Voir également
- ADN ancien
- Rétrovirus endogène
- Projet du génome humain
- Mutagenèse insertionnelle
- Virus irisé des invertébrés 31
- Micropaléontologie
- Paléobiologie
- Paléogénétique
- Eucaryogenèse virale