Rang taxonomique - Taxonomic rank

Les grands rangs : domaine, royaume, embranchement, classe, ordre, famille, genre et espèce, appliqués au renard roux , Vulpes vulpes .
Life Domain Kingdom Phylum Class Order Family Genus Species
La hiérarchie des huit principaux rangs taxonomiques de la classification biologique . Les classements mineurs intermédiaires ne sont pas affichés.

Dans la classification biologique , le rang taxonomique est le niveau relatif d'un groupe d'organismes (un taxon ) dans une hiérarchie taxonomique . Des exemples de rangs taxonomiques sont l' espèce , le genre , la famille , l' ordre , la classe , le phylum , le royaume , le domaine , etc .

Un rang donné englobe sous lui des catégories moins générales, c'est-à-dire des descriptions plus spécifiques des formes de vie. Au-dessus, chaque rang est classé dans des catégories plus générales d'organismes et de groupes d'organismes liés les uns aux autres par l'héritage de traits ou de caractéristiques d'ancêtres communs. Le rang de toute espèce et la description de son genre sont basiques ; ce qui signifie que pour identifier un organisme particulier, il n'est généralement pas nécessaire de spécifier d'autres rangs que ces deux premiers.

Considérons une espèce particulière, le renard roux , Vulpes vulpes : le rang suivant, le genre Vulpes , comprend tous les « vrais » renards. Leurs plus proches parents appartiennent au rang immédiatement supérieur, la famille des canidés , qui comprend les chiens, les loups, les chacals et tous les renards ; le rang immédiatement supérieur, l'ordre des Carnivores , comprend les caniformes (ours, phoques, belettes, mouffettes, ratons laveurs et tous ceux mentionnés ci-dessus) et les féliformes (chats, civettes, hyènes, mangoustes). Les carnivores sont un groupe de membres velus, à sang chaud et allaitants de la classe des Mammalia , qui sont classés parmi les animaux à colonne vertébrale dans le phylum Chordata , et avec eux parmi tous les animaux du royaume Animalia . Enfin, au rang le plus élevé, tous ceux-ci sont regroupés avec tous les autres organismes possédant des noyaux cellulaires dans le domaine Eukarya .

Le Code international de nomenclature zoologique définit le rang comme : "Le niveau, à des fins de nomenclature, d'un taxon dans une hiérarchie taxonomique (par exemple, toutes les familles sont à des fins de nomenclature au même rang, qui se situe entre la superfamille et la sous-famille)."

Rangs principaux

Dans ses publications phares, telles que le Systema Naturae , Carl Linnaeus a utilisé une échelle de classement limitée à : royaume, classe, ordre, genre, espèce et un rang en dessous de l'espèce. Aujourd'hui, la nomenclature est réglementée par les codes de nomenclature . Il existe sept principaux rangs taxonomiques : royaume, embranchement ou division, classe, ordre, famille, genre, espèce. De plus, le domaine (proposé par Carl Woese ) est maintenant largement utilisé comme rang fondamental, bien qu'il ne soit mentionné dans aucun des codes de nomenclature, et est un synonyme de dominion (lat. dominium), introduit par Moore en 1974.

Principaux rangs taxonomiques
Latin Anglais
région domaine
regnum Royaume
phylum phylum (en zoologie ) / division (en botanique )
classe classer
ordo ordre
famille famille
genre genre
espèce espèce

Un taxon se voit généralement attribuer un rang lorsqu'on lui donne son nom officiel. Les rangs de base sont l'espèce et le genre. Lorsqu'un organisme reçoit un nom d'espèce, il est attribué à un genre, et le nom de genre fait partie du nom d'espèce.

Le nom de l'espèce est aussi appelé un binôme , c'est-à-dire un nom à deux termes. Par exemple, le nom zoologique de l'espèce humaine est Homo sapiens . Ceci est généralement en italique dans l'imprimé, ou souligné lorsque les italiques ne sont pas disponibles. Dans ce cas, Homo est le nom générique et il est en majuscule ; sapiens indique l'espèce et il n'est pas en majuscule.

Rangs en zoologie

Il existe des définitions des rangs taxonomiques suivants dans le Code international de nomenclature zoologique : superfamille, famille, sous-famille, tribu, sous-tribu, genre, sous-genre, espèce, sous-espèce.

Le Code international de nomenclature zoologique divise les noms en « noms de groupes familiaux », « noms de groupes de genres » et « noms de groupes d'espèces ». Le Code mentionne explicitement les rangs suivants pour ces catégories :


Superfamille

Famille

Sous-famille
Tribu
Sous-tribu

Genre

Sous-genre

Espèce

Sous-espèce

Les règles du Code s'appliquent aux rangs de superfamille aux sous-espèces, et seulement dans une certaine mesure à celles au-dessus du rang de superfamille. Parmi les "noms de groupe-genre" et les "noms de groupe-espèce", aucun autre rang n'est officiellement autorisé. Zoologistes utilisent parfois des termes supplémentaires tels que le groupe d'espèces , sous - groupe d'espèces , espèces complexes et superspecies par commodité supplémentaire, mais non officiel, les rangs entre les niveaux de sous - genre et espèces dans les taxons avec de nombreuses espèces, par exemple le genre Drosophila . (Notez l'utilisation potentiellement déroutante de "groupe d'espèces" à la fois comme catégorie de rangs et comme rang non officiel lui-même.)

Aux rangs supérieurs (famille et au-dessus), un niveau inférieur peut être indiqué en ajoutant le préfixe « infra », signifiant inférieur , au rang. Par exemple, infra ordre (sous sous-ordre) ou infra famille (sous sous-famille).

Noms des taxons zoologiques

  • Un taxon au-dessus du rang d'espèce a un nom scientifique dans une partie (un nom uninominal).
  • Une espèce a un nom composé de deux parties (un nom binomial ou binome ) : nom générique + nom spécifique ; par exemple Canis lupus .
  • Une sous-espèce a un nom composé de trois parties (un nom trinôme ou trinôme ) : nom générique + nom spécifique + nom sous- spécifique ; par exemple Canis lupus familiaris . Comme il n'y a qu'un seul rang possible en dessous de celui des espèces, aucun terme de connexion pour indiquer le rang n'est nécessaire ou utilisé.

Grades en botanique

Selon l'article 3.1 du Code international de nomenclature pour les algues, les champignons et les plantes (ICN), les rangs les plus importants des taxons sont : royaume, division ou embranchement, classe, ordre, famille, genre et espèce. Selon l'article 4.1, les rangs secondaires des taxons sont la tribu, la section, la série, la variété et la forme. Il y a un nombre indéterminé de rangs. L'ICN mentionne explicitement :


rangs primaires

rangs secondaires
rangs supplémentaires

royaume ( regnum )

sous-règne

division ou phylum ( divisio , phylum )

subdivisio ou subphylum

classe ( classe )

sous-classe

ordre ( ordo )

subordo

famille ( famille )

sous-famille
tribu ( tribus )
abonnements

genre ( genre )

sous-genre
section ( sectio )
sous-section
série ( série )
sous-série

espèce ( espèce )

sous-espèce
variété ( varietas )
sous-variétés
former ( forma )
sous-forma

Il existe des définitions des catégories taxonomiques suivantes dans le Code international de nomenclature des plantes cultivées : groupe cultivar , cultivar , Grex .

Les règles de l'ICN s'appliquent principalement aux rangs de la famille et au-dessous, et seulement dans une certaine mesure à ceux au-dessus du rang de la famille. Voir aussi le nom botanique descriptif .

Noms des taxons botaniques

Les taxons au rang de genre et au-dessus ont un nom botanique dans une partie (nom unitaire) ; ceux au rang d'espèce et au-dessus (mais au-dessous du genre) ont un nom botanique en deux parties ( nom binaire ) ; tous les taxons inférieurs au rang d'espèce ont un nom botanique en trois parties (un nom infraspécifique ). Pour indiquer le rang du nom infraspécifique, un "terme de connexion" est nécessaire. Ainsi Poa secunda subsp. juncifolia , où "subsp." est une abréviation pour "sous-espèce", est le nom d'une sous-espèce de Poa secunda .

Les hybrides peuvent être spécifiés soit par une "formule hybride" qui spécifie la filiation, soit recevoir un nom. Pour les hybrides recevant un nom hybride , les mêmes rangs s'appliquent, précédés de notho (grec : 'bâtard'), avec nothogenus comme rang autorisé le plus élevé.

Noms obsolètes pour les rangs botaniques

Si un terme différent pour le rang a été utilisé dans une ancienne publication, mais que l'intention est claire, la nomenclature botanique précise certaines substitutions :

  • Si les noms étaient « destinés à être des noms d'ordres, mais publiés avec leur rang désigné par un terme tel que » : « cohortes » [latin pour « cohorte » ; voir aussi étude de cohorte pour l'utilisation du terme en écologie], "nixus", "alliance" ou "Reihe" au lieu de "ordre" (article 17.2), ils sont traités comme des noms d'ordres.
  • « Famille » remplace « ordre » (ordo) ou « ordre naturel » (ordo naturalis) dans certaines conditions où le sens moderne de « ordre » n’était pas destiné. (Article 18.2)
  • "La sous-famille est substituée à "sous-ordre" (subordo) dans certaines conditions où le sens moderne de "sous-ordre" n'était pas prévu. (Article 19.2)
  • Dans une publication antérieure au 1er janvier 1890, si un seul rang infraspécifique est utilisé, il est considéré comme celui de variété. (Article 37.4) Ceci s'applique généralement aux publications qui étiquetaient les taxons infraspécifiques avec des lettres grecques, α, β, , ...

Exemples

Les classifications de cinq espèces suivent : la mouche des fruits familière dans les laboratoires de génétique ( Drosophila melanogaster ), l' homme ( Homo sapiens ), les pois utilisés par Gregor Mendel dans sa découverte de la génétique ( Pisum sativum ), le champignon "mouche agaric" Amanita muscaria , et la bactérie Escherichia coli . Les huit principaux rangs sont indiqués en gras; une sélection de rangs mineurs est également proposée.

Rang Mouche des fruits Humain Pois Amanite mouche E. coli
Domaine Eucarya Eucarya Eucarya Eucarya Bactéries
Royaume Animalia Animalia Plantes Champignons
Embranchement ou division Arthropodes Accords Magnoliophyte ( Tracheophyta ) Basidiomycota Protéobactéries
Sous - embranchement ou subdivision Hexapodes Vertébrés Magnoliophytine ( Euphyllophytine ) Agaricomycotine
Classer Insecte Mammifères Magnoliopsida ( Equisetopsida ) Agaricomycètes Gammaprotéobactéries
Sous-classe Ptérygote Théria Rosidae ( Magnoliidae ) Agaricomycetidae
Supercommande Panorpide Euarchontogires Rosanes
Commander Diptères Primates Fabales Agaricales Entérobactéries
Sous-ordre Brachycère Haplorrhini Fabinées Agaricinee
Famille Drosophilidae Hominidés Fabacées Amanitacées Entérobactéries
Sous-famille Drosophilinae Homininés Faboideae Amanitoideae
Tribu Hominini
Genre Drosophile Homo Pisum Amanite Escherichia
Espèce D. melanogaster H. sapiens P. sativum A. muscaria E. coli
Notes de tableau
  • Afin de garder la table compacte et d'éviter les problèmes techniques contestés, certains rangs intermédiaires communs et peu communs sont omis. Par exemple, les mammifères d'Europe, d'Afrique et de la partie supérieure de l'Amérique du Nord sont dans la classe Mammalia , légion Cladotheria , sous-légion Zatheria , infralegion Tribosphenida , sous - classe Theria , clade Eutheria , clade Placentalia - mais seuls Mammalia et Theria sont dans le tableau. Des arguments légitimes pourraient surgir si les clades couramment utilisés Eutheria et Placentalia étaient tous deux inclus, sur lesquels se trouve le rang « infraclass » et quel devrait être le rang de l'autre, ou si les deux noms sont synonymes.
  • Les rangs des taxons supérieurs, en particulier les rangs intermédiaires, sont sujets à révision à mesure que de nouvelles informations sur les relations sont découvertes. Par exemple, les plantes à fleurs ont été déclassées d'une division (Magnoliophyta) à une sous-classe (Magnoliidae), et le super-ordre est devenu le rang qui distingue les principaux groupes de plantes à fleurs. La classification traditionnelle des primates (classe Mammalia, sous-classe Theria, infraclasse Eutheria, ordre Primates) a été modifiée par de nouvelles classifications telles que McKenna et Bell (classe Mammalia, sous-classe Theriformes, infraclasse Holotheria) avec Theria et Eutheria assignées des rangs inférieurs entre l'infraclasse et le commander des primates. Voir la classification des mammifères pour une discussion. Ces différences surviennent parce qu'il y a peu de rangs disponibles et de nombreux points de branchement dans les archives fossiles.
  • Au sein des espèces, d'autres unités peuvent être reconnues. Les animaux peuvent être classés en sous-espèces (par exemple, Homo sapiens sapiens , les humains modernes) ou en morphes (par exemple Corvus corax varius morpha leucophaeus , le grand corbeau). Les plantes peuvent être classées en sous-espèces (par exemple, Pisum sativum subsp. sativum , le petit pois) ou en variétés (par exemple, Pisum sativum var. macrocarpon , pois mange-tout), les plantes cultivées recevant un nom de cultivar (par exemple, Pisum sativum var . macrocarpon 'Snowbird'). Les bactéries peuvent être classées par souches (par exemple Escherichia coli O157:H7 , une souche qui peut provoquer une intoxication alimentaire ).

Les terminaisons de noms

Les taxons au-dessus du niveau du genre reçoivent souvent des noms basés sur le type genus , avec une terminaison standard. Les terminaisons utilisées pour former ces noms dépendent du royaume (et parfois du phylum et de la classe) comme indiqué dans le tableau ci-dessous.

Les prononciations données sont les plus anglicisées . Plus Latinate prononciations sont également fréquents, en particulier / ɑː / plutôt que / / pour souligner un .

Rang Bactéries Les plantes Algues Champignons Animaux Virus
Division/embranchement -ophyta / ɒ f ɪ t ə , ( ) f t ə / -mycota / m k t ə / -viricota / v ɪ r ɪ k t ə /
Subdivision/sous-embranchement -phytina / f ɪ t n ə / -mycotina / m k t n ə / -viricotina / v ɪ r ɪ k t n ə /
Classer -ia / i ə / -opsida / ɒ p s ɪ d ə / -phyceae / f ʃ i / -mycetes / m s i t i z / -viricetes / v ɪ r ɪ s i t i z /
Sous-classe -idae / ɪ d / -phycidae / f ɪ s ɪ d i / -mycetidae / m s ɛ t ɪ d i / -viricetidae / v ɪ r ɪ s ɛ t ɪ d i /
Supercommande -anae / n i /
Commander -ales / l i z / -iformes / ɪ ( ) f ɔːr m i z / -virales / v r l i z /
Sous-ordre -ineae / ɪ n i i / -virineae / v ɪ r ɪ n i i /
Infra-commande -aria / ɛər i ə /
Superfamille -acea / ʃ ə / -oidea / ɔɪ d i ə /
Épifamille -oidae / ɔɪ d i /
Famille -aceae / ʃ Ï / -idae / ɪ d / -viridae / v ɪr ɪ d i /
Sous-famille -oideae / ɔɪ d i i / -inae / n i / -virineae / v ɪ r ɪ n i i /
Infrafamille -impair / ɒ d /
Tribu -eae / / -ini / n /
Sous-tribu -inae / n i / -ina / n ə /
Infratribe -AD / æ d / ou -iti / t i /
Notes de tableau
  • En botanique et en mycologie, les noms au rang de famille et au-dessous sont basés sur le nom d'un genre, parfois appelé genre type de ce taxon, avec une terminaison standard. Par exemple, la famille des roses, Rosaceae , est nommée d'après le genre Rosa , avec la terminaison standard "-aceae" pour une famille. Les noms au-dessus du rang de famille sont également formés à partir d'un nom générique, ou sont descriptifs (comme Gymnospermae ou Fungi ).
  • Pour les animaux, il existe des suffixes standard pour les taxons uniquement jusqu'au rang de superfamille.
  • Former un nom à partir d'un nom générique n'est peut-être pas simple. Par exemple, l' homo a le génitif hominis , donc le genre Homo (humain) est dans les Hominidae , pas dans "Homidae".
  • Les rangs d'épifamille, d'infrafamille et d'infratribe (chez les animaux) sont utilisés lorsque les complexités de la ramification phylétique nécessitent des distinctions plus fines que d'habitude. Bien qu'ils tombent en dessous du rang de superfamille, ils ne sont pas réglementés par le Code international de nomenclature zoologique et n'ont donc pas de terminaisons standard formelles. Les suffixes listés ici sont réguliers, mais informels.
  • De nombreux ordres d'animaux ont le suffixe informel -ida / ɪ d ə / , par exemple Hyolithida et Nectaspida (Naraoiida)
  • En virologie, les terminaisons formelles des taxons de viroïdes et d' acides nucléiques satellites sont similaires à celles des virus, seule -vir- est remplacée par -viroid-, -satellit-.

Tous les rangs

Le nombre de rangs est indéterminé, car un taxonomiste peut inventer un nouveau rang à sa guise, à tout moment, s'il le juge nécessaire. Ce faisant, il existe certaines restrictions, qui varient selon le code de nomenclature qui s'applique.

Ce qui suit est une synthèse artificielle, uniquement à des fins de démonstration du rang relatif (mais voir les notes), du plus général au plus spécifique :

Importance et problèmes

Les rangs sont attribués en fonction de la dissemblance subjective et ne reflètent pas pleinement la nature graduelle de la variation au sein de la nature. Dans la plupart des cas, les groupements taxonomiques supérieurs apparaissent plus loin dans le temps : non pas parce que le taux de diversification était plus élevé dans le passé, mais parce que chaque événement de diversification ultérieur entraîne une augmentation de la diversité et augmente ainsi le rang taxonomique attribué par les taxonomistes actuels. De plus, certains groupes ont de nombreuses espèces décrites non pas parce qu'elles sont plus diverses que d'autres espèces, mais parce qu'elles sont plus facilement échantillonnées et étudiées que d'autres groupes.

De ces nombreux rangs, le plus fondamental est celui des espèces. Cependant, cela ne veut pas dire qu'un taxon à un autre rang peut ne pas être défini avec précision, ou que toute espèce est garantie d'être définie avec précision. Cela varie d'un cas à l'autre. Idéalement, un taxon est destiné à représenter un clade , c'est-à-dire la phylogénie des organismes en discussion, mais ce n'est pas une exigence.

Une classification dans laquelle tous les taxons ont des rangs formels ne peut pas refléter de manière adéquate les connaissances sur la phylogénie. Étant donné que les noms des taxons dépendent des rangs dans les systèmes de classification traditionnels linnéens, les taxons sans rangs ne peuvent pas recevoir de noms. Des approches alternatives, telles que l'utilisation de noms de circonscription , évitent ce problème. La difficulté théorique de superposer les rangs taxonomiques sur les arbres évolutionnaires se manifeste par le paradoxe des limites qui peut être illustré par les modèles évolutionnaires darwiniens.

Il n'y a pas de règles sur le nombre d'espèces qui devraient constituer un genre, une famille ou tout autre taxon supérieur (c'est-à-dire un taxon dans une catégorie au-dessus du niveau de l'espèce). Il doit s'agir d'un groupe naturel (c'est-à-dire non artificiel, non polyphylétique ), tel qu'il est jugé par un biologiste, en utilisant toutes les informations dont il dispose. Les taxons supérieurs de rang égal dans différents phylums ne sont pas nécessairement équivalents (par exemple, il est incorrect de supposer que les familles d'insectes sont d'une certaine manière comparables sur le plan de l'évolution aux familles de mollusques). Pour les animaux, au moins le rang du phylum est généralement associé à un certain plan corporel , qui est aussi, cependant, un critère arbitraire.

Mnémonique

Il existe plusieurs acronymes destinés à aider à mémoriser la hiérarchie taxonomique, tels que "King Phillip came over for great spaghetti". Voir mnémonique de taxonomie .

Voir également

Notes de bas de page

Les références

Bibliographie

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