CDK5RAP2 - CDK5RAP2
La protéine 2 associée à la sous-unité régulatrice CDK5 est une protéine qui, chez l'homme, est codée par le gène CDK5RAP2 . Il a des rôles nécessaires dans la formation et la stabilité des microtubules du centrosome et s'est avéré être lié à la variation de la taille du cerveau humain chez les mâles. Plusieurs variantes de transcription existent pour ce gène, mais la nature complète de seulement deux a été déterminée.
CDK5RAP2 est homologue à la protéine de drosophile centrosomine (cnn) et paralogue à la myomégaline , qui chez les mammifères contient un domaine Olduvai , un domaine impliqué dans l'évolution de la taille du cerveau humain.
Fonction
CDK5RAP2 est nécessaire à la formation , à l'ancrage et à l'orientation appropriés des microtubules du centrosome . Il se lie avec la γ-tubuline cycle complexe (γTuRC), ce qui est nécessaire pour le γTuRC pour fixer au centrosome. CDK5RAP2 se lie également à p25, une forme de CDK5R1 qui sert de sous-unité activatrice de CDK5 , qui est impliquée dans la régulation de la différenciation neuronale . CDK5RAP2 a donc un rôle dans la différenciation neuronale. CDK5RAP2 est également nécessaire en tant que protéine d'échafaudage dans la couronne centrosomique de Dictyostelium .
Signification clinique
Variation de la taille du cerveau humain
Une étude IRM a démontré un lien entre la variation humaine commune du gène CDK5RAP2 et la structure du cerveau. Plus précisément, des associations ont été trouvées entre plusieurs polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) et la surface corticale cérébrale et le volume cérébral total. Ces associations ont été trouvées exclusivement chez les sujets masculins, et tous les SNP étaient situés soit dans les 7 derniers introns, soit en aval du gène. La signification fonctionnelle de ces loci n'est pas encore connue. Cependant, étant donné leur emplacement à proximité d' éléments régulateurs , il est possible qu'ils soient impliqués dans la régulation des gènes , ce qui suggère qu'une variance commune dans la structure cérébrale pourrait être associée à des différences dans la régulation des gènes plutôt que dans la structure des protéines, ce qui est cohérent avec les résultats d'autres traits humains complexes. . CDK5RAP2 est un paralogue de la myomégaline , qui chez les mammifères contient un domaine Olduvai , un domaine avec des duplications spécifiques à l'homme qui ont été impliquées dans l'évolution de la taille du cerveau humain.
Microcéphalie primaire autosomique récessive
Des mutations dans CDK5RAP2 provoquent une microcéphalie primaire autosomique récessive de type 3.
Interactions
Il a été démontré que CDK5RAP2 interagit avec CDK5R1 et la péricentrine (PCTN).
Histoire
Le gène a été découvert en 2000 et a été caractérisé pour la première fois en 2007.
Les références
Lectures complémentaires
- Moynihan L, Jackson AP, Roberts E, Karbani G, Lewis I, Corry P, et al. (février 2000). « Un troisième nouveau locus pour les cartes de microcéphalie autosomique récessive primaire sur le chromosome 9q34 » . Journal américain de génétique humaine . 66 (2) : 724-7. doi : 10.1086/302777 . PMC 1288125 . PMID 10677332 .
- Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M, Wang JH (octobre 2000). "Identification d'une région d'association protéique commune dans l'activateur neuronal Cdk5" . Le Journal de Chimie Biologique . 275 (41) : 31763-9. doi : 10.1074/jbc.M004358200 . PMID 10915792 .
- Nagase T, Kikuno R, Nakayama M, Hirosawa M, Ohara O (août 2000). "Prédiction des séquences codantes de gènes humains non identifiés. XVIII. Les séquences complètes de 100 nouveaux clones d'ADNc du cerveau qui codent pour de grandes protéines in vitro" . Recherche ADN . 7 (4) : 273-81. doi : 10.1093/dnares/7.4.271 . PMID 10997877 .
- Ching YP, Pang AS, Lam WH, Qi RZ, Wang JH (mai 2002). "Identification d'une protéine de liaison à l'activateur Cdk5 neuronale en tant qu'inhibiteur de Cdk5" . Le Journal de Chimie Biologique . 277 (18) : 15237–40. doi : 10.1074/jbc.C200032200 . PMID 11882646 .
- Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (novembre 2002). « Interactions protéine-protéine entre grandes protéines : criblage à deux hybrides à l'aide d'une bibliothèque classée fonctionnellement composée de longs ADNc » . Recherche sur le génome . 12 (11) : 1773-1784. doi : 10.1101/gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .
- Andersen JS, Wilkinson CJ, Mayor T, Mortensen P, Nigg EA, Mann M (décembre 2003). « Caractérisation protéomique du centrosome humain par profilage de corrélation de protéines ». Nature . 426 (6966) : 570-4. Bibcode : 2003Natur.426..570A . doi : 10.1038/nature02166 . PMID 14654843 . S2CID 4427303 .
- Bond J, Roberts E, Springell K, Lizarraga SB, Lizarraga S, Scott S, et al. (avril 2005). « Un mécanisme centrosomal impliquant CDK5RAP2 et CENPJ contrôle la taille du cerveau ». Génétique de la nature . 37 (4) : 353-5. doi : 10.1038/ng1539 . PMID 15793586 . S2CID 1763877 .
- Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (avril 2006). "Analyse du phosphoprotéome du fuseau mitotique humain" . Actes de l'Académie nationale des sciences des États-Unis d'Amérique . 103 (14) : 5391-6. Bibcode : 2006PNAS..103.5391N . doi : 10.1073/pnas.0507066103 . PMC 1459365 . PMID 16565220 .
- Evans PD, Vallender EJ, Lahn BT (juin 2006). « L'évolution moléculaire des gènes régulateurs de la taille du cerveau CDK5RAP2 et CENPJ ». Gène . 375 : 75-9. doi : 10.1016/j.gene.2006.02.019 . PMID 16631324 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (novembre 2006). « Dynamique de phosphorylation globale, in vivo et site-spécifique dans les réseaux de signalisation » . Cellule . 127 (3) : 635-48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Liens externes
- Emplacement du génome humain CDK5RAP2 et page de détails du gène CDK5RAP2 dans le navigateur de génome de l' UCSC .