Base de données ouverte de cristallographie - Crystallography Open Database

Base de données ouverte de cristallographie (COD)
Database.png
Contenu
La description Structures cristallines et plateforme pour une collaboration mondiale
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Centre de recherche Université de Vilnius
Auteurs Saulius Gražulis
Citation principale Gražulis et al. (2012)
Date de sortie 2004
Accès
Format des données Fichier d'informations cristallographiques (.cif)
Site Internet http://www.crystallography.net
Public SQL accès http://wiki.crystallography.net/howtoquerycod/

La base de données ouverte de cristallographie ( COD ) est une base de données de structures cristallines . Contrairement aux bases de données de cristallographie similaires , la base de données est entièrement à accès libre, les utilisateurs enregistrés étant capables de contribuer à la base de données sur des structures publiées et non publiées de petites molécules et de cristaux de cellules unitaires de taille petite à moyenne. En mai 2016, la base de données comptait plus de 360 ​​000 entrées. La base de données a plusieurs contributeurs et contient des fichiers d'informations cristallographiques tels que définis par l' Union internationale de cristallographie (UICr). Il existe actuellement cinq sites dans le monde qui reflètent cette base de données. Les structures 3D des composés peuvent être converties en fichiers d'entrée pour les imprimantes 3D.

Voir également

Les références

  1. ^ un b Gražulis, Saulius; Daškevič Adriana; Merkys Andrius; Chateigner Daniel; Lutterotti Luca; Quirós Miguel; Serebryanaya Nadezhda R; Moeck Peter; Downs Robert T; Le Bail Armel (janvier 2012). "Crystallography Open Database (COD): une collection en libre accès de structures cristallines et plate-forme pour une collaboration mondiale" . Nucleic Acids Res . Angleterre. 40 (problème de base de données): D420-7. doi : 10.1093 / nar / gkr900 . PMC   3245043 . PMID   22070882 .
  2. ^ Oxford Journal - Nucleic Acids Research Crystallography Open Database (COD): une collection en libre accès de structures cristallines et une plate-forme pour une collaboration mondiale 5 octobre 2011
  3. ^ Scalfani, Vincent F .; Williams, Antony J .; Tkachenko, Valery; Karapetyan, Karen; Pshenichnov, Alexey; Hanson, Robert M .; Liddie, Jahred M .; Bara, Jason E. (23 novembre 2016). "Conversion programmatique des structures cristallines en fichiers imprimables 3D en utilisant Jmol" . Journal of Cheminformatics . 8 (1). doi : 10.1186 / s13321-016-0181-z . PMC   5122160 .

Liens externes