Projet Atlas du paludisme - Malaria Atlas Project
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| Abréviation | CARTE |
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| Formation | 1er mai 2006 |
| Objectif | Détermination des limites spatiales du paludisme à Plasmodium falciparum et à Plasmodium vivax à l'échelle mondiale et son endémicité dans cette plage |
| Quartier général | Perth, Australie |
Région desservie |
Global |
Langue officielle |
Anglais |
Chef de groupe |
Professeur Peter Gething |
Organisation parente |
Institut Téléthon pour enfants |
| Site Internet | https://malariaatlas.org/ |
Le Malaria Atlas Project , en abrégé MAP, est un groupe universitaire à but non lucratif dirigé par le professeur Peter Gething, titulaire de la chaire Kerry M Stokes en santé infantile, au Telethon Kids Institute , Perth, Australie occidentale. Le groupe est financé par la Fondation Bill et Melinda Gates , les financements antérieurs provenant également du Medical Research Council et du Wellcome Trust . Le PAM vise à diffuser des informations gratuites, précises et à jour sur le paludisme et les sujets associés, organisées sur une base géographique. Le travail du PAM se divise en trois domaines:
- L'estimation de la distribution spatiale de la prévalence et de l'incidence du paludisme et des sujets connexes tels que la distribution spatiale des moustiquaires imprégnées d' insecticide , des antipaludiques , des moustiques vecteurs et des troubles sanguins humains
- Diffusion des données sur le paludisme via le projet Repository for Open Access Data (ROAD-MAP)
- Fourniture de cartes relatives à la prévalence du paludisme et aux sujets connexes pour l' Organisation mondiale de la santé (OMS) et d'autres organismes.
L'équipe MAP a réuni une base de données spatiale unique sur des informations liées dérivées de renseignements médicaux, des données climatiques dérivées par satellite pour limiter les limites de la transmission du paludisme et la plus grande archive jamais réalisée d'estimations communautaires de la prévalence des parasites. Ces données ont été rassemblées et analysées par une équipe de géographes , statisticiens , épidémiologistes , biologistes et spécialistes de la santé publique . De plus, lorsque ces données ont été autorisées à être publiées, elles sont disponibles via un outil d'exploration de données sur le site Web du PAM.
Histoire
MAP a été fondée par Bob Snow et Simon Hay en 2005 pour combler le créneau de la communauté de lutte contre le paludisme à l'échelle mondiale. Entre 2012 et 2015, il était dirigé par Peter Gething, Dave Smith, Catherine Moyes et Simon Hay . L'objectif initial du MAP était de prédire l'endémicité de Plasmodium falciparum , la forme la plus mortelle du parasite du paludisme, en raison de son importance épidémiologique mondiale et de ses meilleures perspectives d'élimination et de contrôle. En 2009, des travaux ont commencé à cartographier l'étendue et le fardeau du Plasmodium vivax, relativement négligé .
Le référentiel des données en libre accès du Malaria Atlas Project (ROAD-MAP) a été créé par Catherine Moyes, Simon Hay et Bob Snow en 2011. Entre 2014 et 2019, il était dirigé par Peter Gething et Mike Thorn.
Recherche académique
Modélisation de la prévalence du paludisme
Un aspect clé du travail du PAM consiste à utiliser des approches statistiques pour modéliser la prévalence de différentes formes de paludisme à l'échelle mondiale à l'aide de la géostatistique bayésienne basée sur des modèles .
On sait que divers facteurs environnementaux affectent la prévalence du paludisme. On sait que la prévalence du paludisme varie de manière relativement prévisible dans l'espace et dans le temps, et la prévalence observée du paludisme dépend fortement de l'âge des personnes et de la couverture des interventions.
En épidémiologie spatiale , il est courant de constater que très peu de mesures ont été prises dans de grandes parties de la région géographique d'intérêt. Les mesures disponibles peuvent être sujettes à des erreurs ou rapportées de manière incomplète, et il s'agit presque toujours d'un sous-ensemble de la population locale qui a fait l'objet d'une enquête.
Depuis 2005, le PAM a rassemblé une vaste base de données de données d'enquête provenant de diverses sources. Ces enquêtes sont généralement regroupées au niveau du village et enregistrent des données sur les taux de positivité des parasites, généralement déterminés par des tests sanguins de diagnostic rapide. De plus, le MAP a rassemblé des données détaillées sur des covariables telles que l'adéquation de la température et la couverture terrestre. Ces facteurs affectent la distribution des moustiques vecteurs responsables de la propagation du paludisme.
L'avantage de l'utilisation de la géostatistique basée sur un modèle bayésien est qu'elle transmet le niveau d'incertitude spatialement variable associé à la surface cartographiée.
La probabilité que l'une des très nombreuses cartes individuelles (candidates) soit la seule bonne carte est faible, il n'est donc pas utile de signaler la carte la plus probable. Prises ensemble, cependant, les cartes candidates permettent de calculer la probabilité d'exactitude des déclarations sur la carte, telles que l' endémicité de Plasmodium falciparum à l'emplacement x en 2010 était comprise entre 0,1 et 0,3 ".
Cartes de prévalence de Plasmodium falciparum
Depuis l'an 2000, une campagne concertée contre le paludisme a conduit à des niveaux de couverture d'intervention sans précédent en Afrique subsaharienne . La planification des contrôles futurs dépend de la compréhension de l'effet de cet effort. Cependant, l'effet des interventions antipaludiques dans les divers contextes épidémiologiques de l'Afrique reste mal compris en raison de l'absence de données de surveillance fiables et des approches simplistes qui sous-tendent les estimations actuelles de la maladie.
En septembre 2015, une recherche du MAP publiée dans Nature a quantifié l'effet attribuable des efforts de lutte contre le paludisme en Afrique. Les résultats ont montré que la prévalence de l'infection à Plasmodium falciparum en Afrique endémique a diminué de moitié et que l'incidence des maladies cliniques a chuté de 40% entre 2000 et 2015. La meilleure estimation est que les interventions ont permis d'éviter 663 millions de cas cliniques depuis 2000. Les moustiquaires imprégnées d'insecticide, l'intervention la plus répandue , étaient de loin le plus gros contributeur. Bien que toujours en deçà des niveaux cibles, les interventions actuelles contre le paludisme ont considérablement réduit l'incidence du paludisme sur le continent.
Cartes de prévalence de Plasmodium vivax
En 2012, MAP a publié les premières cartes mondiales de l' endémicité de Plasmodium vivax .
Collecte, conservation et diffusion des données
Rapports de l'OMS sur le paludisme dans le monde
L'équipe du PAM travaille en collaboration avec l' Organisation mondiale de la santé (OMS) pour fournir les estimations de prévalence pour les pays d'Afrique subsaharienne pour le rapport annuel sur le paludisme dans le monde. En outre, le PAM aide l'OMS à produire les cartes des taux de prévalence annuels dans le Rapport mondial sur le paludisme.
Curation continue des données
La base de données MAP est la plus grande source de données paludométriques traitées disponible.
En avril 2015, la base de données MAP contenait:
- L'enquête sur le taux de parasites de 40000 emplacements de grappes géoréférencés provenant de 2010 sources
- La base de données contient environ 50000 enregistrements annuels d'incidence des parasites (ci-après API) pour les années 2002 à 2010.
MAP recherche et gère activement une grande variété de données supplémentaires provenant de différentes sources, y compris les suivantes:
- Données des indicateurs de couverture des interventions antipaludiques
- Données de taux de parasites
- Données annuelles sur l'incidence des parasites
- Données de recherche de traitement
- Données satellites pour fournir des surfaces raster covariantes
- Données sur les troubles sanguins
- Bionomique des moustiques et données de distribution
MAP s'engage à la diffusion libre et ouverte de ces données (lorsque l'autorisation a été accordée par le propriétaire des données pour les divulguer). La diffusion des données est facilitée via la page Web principale du PAM et l'outil Explorer. Ce dernier permet aux utilisateurs de télécharger des données tabulaires sur le paludisme par pays.
Voir également
Les références
Liens externes
- Projet Atlas du paludisme - Site officiel