TRIM21 - TRIM21

TRIM21
Structures disponibles
APD	Recherche orthologue : PDBe RCSB
Liste des codes d'identification PDB
	2IWG
Identifiants
Alias	TRIM21 , RNF81, RO52, Ro/SSA, SSA, SSA1, motif tripartite contenant 21, protéine contenant le motif tripartite 21
Identifiants externes	OMIM : 109092 MGI : 106657 HomoloGene : 2365 GeneCards : TRIM21
Emplacement du gène ( humain )
Chr.	Chromosome 11 (humain)
Finir	4 393 702 pb
Emplacement du gène ( Souris )
Chr.	Chromosome 7 (souris)
Finir	102 565 486 pb
Modèle d' expression de l'ARN
	Plus de données d'expression de référence
ontologie du gène
Fonction moléculaire	• liaison de l' ADN ; • liaison des ions zinc ; • ion métallique de liaison ; • GO: 0001948 protéine de liaison ; • liaison de l' ARN ; • protéine de liaison identique ; • activité de transferase ubiquitine-protéine ; • activité de transferase;
Composant cellulaire	• cytoplasme ; • cytosol ; • SCF complexe ubiquitine ligase ; • Corps P ; • structure anatomique intracellulaire ; • autophagosome ; • GO:0016023 vésicule cytoplasmique ; • noyau ; • nucléoplasme ; • complexe ribonucléoprotéique;
Processus biologique	• régulation négative de la désubiquitination des protéines ; • réponse à l'interféron gamma ; • régulation positive de l'autophagie ; • voie de signalisation médiée par l'interféron gamma ; • trimérisation des protéines ; • régulation positive de l'entrée virale dans la cellule hôte ; • régulation positive de l'activité du facteur de transcription de liaison à l'ADN ; • monoubiquitination des protéines ; • régulation de la production d'interféron de type I ; • régulation positive du cycle cellulaire ; • déstabilisation des protéines ; • ubiquitination des protéines ; • cycle cellulaire ; • régulation négative de l'activité du facteur de transcription NF-kappaB ; • autoubiquitination des protéines ; • réponse immunitaire innée ; • polyubiquitination des protéines ; • régulation négative de la transcription virale ; • négatif régulation de la libération virale de la cellule hôte;
	Sources : Amigo / QuickGO
Orthologues
	6737
	20821
	ENSG00000132109
	ENSMUSG00000030966
	P19474
	Q62191
	NM_003141
	NM_001082552 ; NM_009277
	NP_003132
	n / A
	Wikidata
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La protéine 21 contenant un motif tripartite , également connue sous le nom d' ubiquitine-protéine ligase E3 TRIM21 , est une protéine qui, chez l'homme, est codée par le gène TRIM21 . Des variantes de transcrits épissés de manière alternative pour ce gène ont été décrites, mais la nature complète d'un seul a été déterminée. Il est exprimé dans la plupart des tissus humains.

Structure

TRIM21 fait partie de la famille des motifs tripartites (TRIM). Le motif TRIM comprend trois domaines de liaison de zinc, d' un domaine à doigt RING , un type-boîte de B 1 et de type boîte B 2 doigts de zinc , et une bobine enroulée région.

Fonction

TRIM21 est un effecteur d'anticorps intracellulaire dans la voie de protéolyse médiée par les anticorps intracellulaires . Il reconnaît le domaine Fc et se lie à l' immunoglobuline G , à l' immunoglobuline A et à l' immunoglobuline M sur des virions non enveloppés marqués d'anticorps qui ont infecté la cellule. Soit par autoubiquitination, soit par ubiquitination d'un cofacteur, il est alors chargé de diriger les virions vers le protéasome . TRIM21 lui-même n'est pas dégradé dans le protéasome contrairement à la capside virale et à l'anticorps lié.

TRIM21 fait partie de la ribonucléoprotéine RoSSA, qui comprend un seul polypeptide et l'une des quatre petites molécules d'ARN. La particule RoSSA se localise à la fois dans le cytoplasme et dans le noyau.

Signification clinique

RoSSA interagit avec les auto-antigènes chez les patients atteints du syndrome de Sjögren et du lupus érythémateux disséminé . De plus, l'incapacité des macrophages à tendance lupique à dégrader les complexes immuns dans le lysosome entraîne la fuite d'auto-anticorps dans le cytosol qui peuvent se lier à TRIM21 et améliorer la signalisation NF-κB.

TRIM21 peut être utilisé pour éliminer des protéines spécifiques avec leurs anticorps correspondants, une méthode connue sous le nom de Trim-Away. Dans cet essai, TRIM21 et les anticorps sont délivrés dans les cellules par électroporation et la protéine ciblée est dégradée en quelques minutes.

Les références

Lectures complémentaires

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