Récepteur kinase B de la tropomyosine - Tropomyosin receptor kinase B

NTRK2
Structures disponibles
APD	Recherche orthologue : PDBe RCSB
Liste des codes d'identification PDB
	4AT5 , 1HCF , 1WWB , 2MFQ , 4ASZ , 4AT3 , 4AT4
Identifiants
Alias	NTRK2 , GP145-TrkB, TRKB, trk-B, récepteur neurotrophique tyrosine kinase 2, OBHD, EIEE58
Identifiants externes	OMIM : 600456 MGI : 97384 HomoloGene : 4504 GeneCards : NTRK2
Emplacement du gène ( humain )
Chr.	Chromosome 9 (humain)
Finir	85 027 070 pb
Emplacement du gène ( souris )
Chr.	Chromosome 13 (souris)
Finir	59 133 970 pb
Modèle d' expression de l'ARN
	; ; ; ;
	Plus de données d'expression de référence
ontologie du gène
Fonction moléculaire	• neurotrophine liaison ; • l' activité du récepteur de neurotrophine ; • activité kinase ; • activité de tyrosine kinase de la protéine de récepteur transmembranaire ; • liaison de l' ATP ; • activité de la protéine kinase ; • le facteur neurotrophique dérivé du cerveau liaison ; • activité transferase ; • activité homodimérisation de protéines ; • activité de tyrosine kinase protéique ; • nucléotidique liaison ; • dérivé du cerveau activité des récepteurs activés par le facteur neurotrophique ; • GO:0001948 liaison aux protéines ; • récepteur tyrosine kinase ; • activité des récepteurs de signalisation transmembranaire;
Composant cellulaire	• cytosol ; • endosome ; • membrane postsynaptique ; • membrane ; • bouton terminal ; • partie intégrante de la membrane ; • récepteur complexe ; • endosome membrane ; • composante intégrale de la membrane plasmique ; • GO: 0097483, GO: 0097481 densité postsynaptique ; • endosomes précoces ; • membrane endosome précoce ; • membrane plasmatique ; • axone ; • dendrite ; • région périnucléaire du cytoplasme ; • cytoplasme ; • projection cellulaire ; • épine dendritique ; • terminaison axonale ; • membrane de Golgi;
Processus biologique	• régulation négative de neurone processus apoptotique ; • développement des neurones du système nerveux périphérique ; • une régulation positive de la phosphorylation de la protéine ; • différenciation oligodendrocyte ; • apprentissage ; • régulation positive de axonogenesis ; • vasculogenèse ; • la phosphorylation des protéines ; • développement des neurones du système nerveux central ; • le développement de la jonction neuromusculaire ; • le développement des cellules de la tige de la rétine ; • rythme circadien ; • comportement alimentaire ; • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 régulation de l'activité GTPase ; • régulation positive de la phosphorylation de la peptidyl-sérine ; • voie de signalisation du récepteur du facteur neurotrophique dérivé du cerveau ; • régulation de la protéine signalisation de la kinase B ; • régulation du processus métabolique ; • régulation positive de la cascade MAPK ; • différenciation cellulaire ; • phosphorylation ; • migration des neurones ; • différenciation des mécanorécepteurs ; • développement du système nerveux ; • sécrétion de glutamate ; • développement de la rétine dans un œil de type caméra ; • différenciation des neurones ; • développement du cortex cérébral ; • r négatif régulation des anoïkis ; • développement d'organismes multicellulaires ; • régulation positive de l'expression des gènes ; • régulation positive de la prolifération de la population cellulaire ; • régulation positive du développement de la projection des neurones ; • réponse cellulaire au stimulus d'acides aminés ; • régulation positive de la signalisation phosphatidylinositol 3-kinase ; • phosphorylation peptidyl-tyrosine ; • longue -terme synaptique potentialisation ; • une régulation positive de synapse assemblage ; • voie de la protéine de récepteur transmembranaire tyrosine signalisation kinase ; • protéine autophosphorylation ; • signalisation trans-synaptique par neuropeptide, la modulation de la transmission synaptique ; • activation de l' activité phospholipase C ; • voie de signalisation du récepteur neurotrophine TRK ; • une régulation positive de non- activité de la protéine tyrosine kinase couvrant la membrane ; • signalisation trans-synaptique par BDNF, modulant la transmission synaptique ; • régulation négative de la transduction du signal ; • propagation du potentiel d'action neuronale ; • myélinisation dans le système nerveux périphérique ; • régulation négative des apoptotes processus c ; • régulation positive de la cascade ERK1 et ERK2 ; • réponse cellulaire au stimulus du facteur de croissance nerveuse ; • régulation de la cascade MAPK ; • réponse cellulaire au stimulus du facteur neurotrophique dérivé du cerveau;
	Sources : Amigo / QuickGO
Orthologues
	4915
	18212
	ENSG00000148053
	ENSMUSG00000055254
	Q16620
	P15209
NM_001007097 ; NM_001018064 ; NM_001018065 ; NM_001018066 ; NM_001291937;
	NM_006180
	NM_001025074 ; NM_008745 ; NM_001282961
NP_001007098 ; NP_001018074 ; NP_001018075 ; NP_001018076 ; NP_001278866;
	NP_006171 ; NP_001356461 ; NP_001356462 ; NP_001356463 ; NP_001356464 ; NP_001356465 ; NP_001356466 ; NP_001356467 ; NP_001356468 ; NP_001356469 ; NP_001356470 ; NP_001356471 ; NP_001356472 ; NP_001356473 ; NP_001356474 ; NP_001356475 ; NP_001356476 ; NP_001356477 ; NP_001356478 ; NP_001356479 ; NP_001356480 ; NP_001356481
	NP_001020245 ; NP_001269890 ; NP_032771
	Wikidata
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Le récepteur kinase B de la tropomyosine ( TrkB ), également connu sous le nom de récepteur kinase B de la tyrosine , ou récepteur des facteurs de croissance BDNF/NT-3 ou récepteur de la tyrosine kinase neurotrophique, de type 2 est une protéine qui, chez l'homme, est codée par le gène NTRK2 . TrkB est un récepteur du facteur neurotrophique dérivé du cerveau (BDNF). La prononciation standard est "track bee".

Fonction

Le récepteur kinase B de la tropomyosine est le récepteur catalytique de haute affinité pour plusieurs « neurotrophines », qui sont de petits facteurs de croissance protéiques qui induisent la survie et la différenciation de populations cellulaires distinctes. Les neurotrophines qui activent TrkB sont : le BDNF (Brain Derived Neurotrophic Factor), la neurotrophine-4 (NT-4) et la neurotrophine-3 (NT-3). En tant que tel, TrkB médie les multiples effets de ces facteurs neurotrophiques, notamment la différenciation et la survie neuronales. La recherche a montré que l'activation du récepteur TrkB peut entraîner une régulation négative du transporteur de chlorure KCC2 dans les cellules du SNC.

Le récepteur TrkB fait partie de la grande famille des récepteurs tyrosine kinases. Une "tyrosine kinase " est une enzyme qui est capable d'ajouter un groupe phosphate à certaines tyrosines sur des protéines cibles, ou "substrats". Un récepteur tyrosine kinase est une "tyrosine kinase" qui est située au niveau de la membrane cellulaire et est activée par la liaison d'un ligand au domaine extracellulaire du récepteur. D'autres exemples de récepteurs de tyrosine kinase comprennent le récepteur de l' insuline , le récepteur IGF1, le récepteur de la protéine MuSK , le récepteur du facteur de croissance endothélial vasculaire (ou VEGF), etc.

Signalisation TrkB

Actuellement, il existe trois isoformes de TrkB dans le SNC des mammifères. L'isoforme pleine longueur (TK+) est un récepteur de tyrosine kinase typique et transduit le signal BDNF via Ras-ERK, PI3K et PLCγ. En revanche, deux isoformes tronquées (TK- : T1 et T2) possèdent le même domaine extracellulaire, le même domaine transmembranaire et les 12 premières séquences d'acides aminés intracellulaires que TK+. Cependant, les séquences C-terminales sont spécifiques à l'isoforme (11 et 9 acides aminés, respectivement). T1 possède la cascade de signalisation originale qui est impliquée dans la régulation de la morphologie cellulaire et de l'afflux de calcium.

Membres de la famille

TrkB fait partie d'une sous-famille de protéines kinases qui comprend également TrkA et TrkC . Il existe d'autres facteurs neurotrophiques structurellement liés au BDNF : NGF (pour Nerve Growth Factor ), NT-3 (pour Neurotrophin-3) et NT-4 (pour Neurotrophin-4). Alors que TrkB médie les effets du BDNF, NT-4 et NT-3, TrkA est lié et donc activé uniquement par le NGF. De plus, TrkC se lie et est activé par NT-3.

TrkB lie BDNF et NT-4 plus fortement qu'il ne lie NT-3. TrkC lie NT-3 plus fortement que TrkB.

LNGFR

Il existe un autre récepteur BDNF en plus de TrkB, appelé le « LNGFR » (pour « low-affinity nerf growth factor receptor »). Contrairement à TrkB, le LNGFR joue un rôle un peu moins clair dans la biologie du BDNF. Certains chercheurs ont montré que le LNGFR se lie et sert de "puits" pour les neurotrophines. Les cellules qui expriment à la fois les récepteurs LNGFR et Trk pourraient donc avoir une activité plus importante - car elles ont une "microconcentration" plus élevée de la neurotrophine. Il a également été montré, cependant, que le LNGFR peut signaler à une cellule de mourir par apoptose - donc par conséquent, les cellules exprimant le LNGFR en l'absence de récepteurs Trk peuvent mourir plutôt que de vivre en présence d'une neurotrophine.

Rôle dans le cancer

Bien qu'identifiée à l'origine comme une fusion oncogène en 1982, ce n'est que récemment qu'il y a eu un regain d'intérêt pour la famille Trk en ce qui concerne son rôle dans les cancers humains en raison de l'identification de NTRK1 (TrkA), NTRK2 (TrkB) et NTRK3 (TrkC) fusions de gènes et autres altérations oncogènes dans un certain nombre de types de tumeurs. Un certain nombre d' inhibiteurs de Trk sont (en 2015) en essais cliniques et se sont révélés très prometteurs dans la réduction des tumeurs humaines.

En tant que cible médicamenteuse

Entrectinib (anciennement RXDX-101) est un médicament expérimental développé par Ignyta, Inc., qui a une activité antitumorale potentielle. Il s'agit d'un inhibiteur sélectif du récepteur pan-trk de la tyrosine kinase (TKI) ciblant les fusions de gènes dans trkA , trkB (ce gène) et trkC (respectivement codé par les gènes NTRK1 , NTRK2 et NTRK3 ) qui est actuellement en phase 2 de tests cliniques.

Ligands

Interactions

Il a été démontré que TrkB interagit avec :

Facteur neurotrophique dérivé du cerveau (BDNF),
FYN ,
NCK2 ,
PLCG1 ,
Séquestosome 1 , et
SHC3 .

Voir également

Récepteur Trk

Les références

Lectures complémentaires

Klein R, Conway D, Parada LF, Barbacid M (mai 1990). « Le gène trkB tyrosine protéine kinase code pour un deuxième récepteur neurogène dépourvu du domaine catalytique de la kinase ». Cellule . 61 (4) : 647-56. doi : 10.1016/0092-8674(90)90476-U . PMID 2160854 . S2CID 20502147 .
Squinto SP, Stitt TN, Aldrich TH, Davis S, Bianco SM, Radziejewski C, Glass DJ, Masiakowski P, Furth ME, Valenzuela DM (mai 1991). « trkB code un récepteur fonctionnel pour le facteur neurotrophique dérivé du cerveau et la neurotrophine-3, mais pas pour le facteur de croissance nerveuse ». Cellule . 65 (5) : 885–93. doi : 10.1016/0092-8674(91)90395-F . PMID 1710174 . S2CID 28853455 .
Rose CR, Blum R, Pichler B, Lepier A, Kafitz KW, Konnerth A (novembre 2003). « TrkB-T1 tronqué médie la signalisation calcique évoquée par les neurotrophines dans les cellules gliales ». Nature . 426 (6962) : 74-8. Bibcode : 2003Natur.426 ... 74R . doi : 10.1038/nature01983 . PMID 14603320 . S2CID 4432074 .
Ohira K, Kumanogoh H, Sahara Y, Homma KJ, Hirai H, Nakamura S, Hayashi M (février 2005). "Un récepteur tronqué de la kinase B liée à la tropomyosine, T1, régule la morphologie des cellules gliales via l'inhibiteur de dissociation Rho GDP 1" . J. Neurosci . 25 (6) : 1343-1353. doi : 10.1523/JNEUROSCI.4436-04.2005 . PMC 6725989 . PMID 15703388 .
Yamada K, Nabeshima T (2003). "Facteur neurotrophique dérivé du cerveau/signalisation TrkB dans les processus de mémoire" . J. Pharmacol. Sci . 91 (4) : 267-70. doi : 10.1254/jphs.91.267 . PMID 12719654 .
Soppet D, Escandon E, Maragos J, Middlemas DS, Reid SW, Blair J, Burton LE, Stanton BR, Kaplan DR, Hunter T, Nikolics K, Parada LF (1991). « Le facteur neurotrophique dérivé du cerveau et la neurotrophine-3 sont des ligands du récepteur trkB de la tyrosine kinase ». Cellule . 65 (5) : 895-903. doi : 10.1016/0092-8674(91)90396-G . PMID 1645620 . S2CID 37843818 .
Squinto SP, Stitt TN, Aldrich TH, Davis S, Bianco SM, Radziejewski C, Glass DJ, Masiakowski P, Furth ME, Valenzuela DM (1991). « trkB code un récepteur fonctionnel pour le facteur neurotrophique dérivé du cerveau et la neurotrophine-3, mais pas pour le facteur de croissance nerveuse ». Cellule . 65 (5) : 885–93. doi : 10.1016/0092-8674(91)90395-F . PMID 1710174 . S2CID 28853455 .
Haniu M, Talvenheimo J, Le J, Katta V, Welcher A, Rohde MF (1995). « Domaine extracellulaire du récepteur de neurotrophine trkB : structure disulfure, sites de N-glycosylation et liaison de ligand ». Cambre. Biochimie. Biophysique . 322 (1) : 256-64. doi : 10.1006/abbi.1995.1460 . PMID 7574684 .
Ip NY, Stitt TN, Tapley P, Klein R, Glass DJ, Fandl J, Greene LA, Barbacid M, Yancopoulos GD (1993). « Similitudes et différences dans la façon dont les neurotrophines interagissent avec les récepteurs Trk dans les cellules neuronales et non neuronales ». Neurone . 10 (2) : 137-49. doi : 10.1016/0896-6273(93)90306-C . PMID 7679912 . S2CID 46072027 .
Slaugenhaupt SA, Blumenfeld A, Liebert CB, Mull J, Lucente DE, Monahan M, Breakefield XO, Maayan C, Parada L, Axelrod FB (1995). "Le gène humain du récepteur neurotrophique de la tyrosine kinase de type 2 (NTRK2) est situé sur le chromosome 9 mais n'est pas le gène de la dysautonomie familiale". Génomique . 25 (3) : 730-2. doi : 10.1016/0888-7543(95)80019-I . PMID 7759111 .
Shelton DL, Sutherland J, Gripp J, Camerato T, Armanini MP, Phillips HS, Carroll K, Spencer SD, Levinson AD (1995). "Trks humains: clonage moléculaire, distribution tissulaire et expression d'immunoadhésines de domaine extracellulaire" . J. Neurosci . 15 (1 Pt 2) : 477–91. doi : 10.1523/JNEUROSCI.15-01-00477.1995 . PMC 6578290 . PMID 7823156 .
Allen SJ, Dawbarn D, Eckford SD, Wilcock GK, Ashcroft M, Colebrook SM, Feeney R, MacGowan SH (1994). « Clonage d'une forme non catalytique de trkB humain et distribution d'ARN messager pour trkB dans le cerveau humain ». Neurosciences . 60 (3) : 825–34. doi : 10.1016/0306-4522(94)90507-X . PMID 7936202 . S2CID 29288978 .
Rydén M, Ibáñez CF (1996). "Liaison de la neurotrophine-3 à p75LNGFR, TrkA et TrkB médiée par un seul épitope fonctionnel distinct de celui reconnu par trkC" . J. Biol. Chem . 271 (10) : 5623-7. doi : 10.1074/jbc.271.10.5623 . PMID 8621424 .
Yamamoto M, Sobue G, Yamamoto K, Terao S, Mitsuma T (1996). "Expression des ARNm pour les facteurs neurotrophiques (NGF, BDNF, NT-3 et GDNF) et leurs récepteurs (p75NGFR, trkA, trkB et trkC) dans le système nerveux périphérique humain adulte et les tissus non neuraux". Neurochem. Rés . 21 (8) : 929-38. doi : 10.1007/BF02532343 . PMID 8895847 . S2CID 20559271 .
Valent A, Danglot G, Bernheim A (1997). « Cartographie des récepteurs de la tyrosine kinase trkA (NTRK1), trkB (NTRK2) et trkC (NTRK3) sur les chromosomes humains 1q22, 9q22 et 15q25 par hybridation in situ en fluorescence ». EUR. J. Hum. Genet . 5 (2) : 102-4. doi : 10.1159/000484742 . PMID 9195161 .
Haniu M, Montestruque S, Bures EJ, Talvenheimo J, Toso R, Lewis-Sandy S, Welcher AA, Rohde MF (1997). "Interactions entre le facteur neurotrophique dérivé du cerveau et le récepteur TRKB. Identification de deux domaines de liaison de ligand dans TRKB soluble par séparation par affinité et réticulation chimique" . J. Biol. Chem . 272 (40) : 25296-303. doi : 10.1074/jbc.272.40.25296 . PMID 9312147 .
Nakamura T, Muraoka S, Sanokawa R, Mori N (1998). "N-Shc et Sck, deux homologues de l'adaptateur Shc exprimés neuronalement. Leur expression régionale différentielle dans le cerveau et leurs rôles dans la neurotrophine et la signalisation Src" . J. Biol. Chem . 273 (12) : 6960-7. doi : 10.1074/jbc.273.12.6960 . PMID 9507002 .
Hackett SF, Friedman Z, Freund J, Schoenfeld C, Curtis R, DiStefano PS, Campochiaro PA (1998). « Une variante d'épissage de trkB et un facteur neurotrophique dérivé du cerveau sont co-exprimés dans les cellules épithéliales pigmentées de la rétine et favorisent des caractéristiques différenciées ». Cerveau Res . 789 (2) : 201-12. doi : 10.1016/S0006-8993(97)01440-6 . PMID 9573364 . S2CID 1814445 .
Iwasaki Y, Gay B, Wada K, Koizumi S (1998). « Association de la famille Src tyrosine kinase Fyn avec TrkB ». J. Neurochem . 71 (1) : 106-11. doi : 10.1046/j.1471-4159.1998.71010106.x . PMID 9648856 . S2CID 9012343 .
Qian X, Riccio A, Zhang Y, Ginty DD (1998). "Identification et caractérisation de nouveaux substrats de récepteurs Trk dans les neurones en développement" . Neurone . 21 (5) : 1017–29. doi : 10.1016/S0896-6273(00)80620-0 . PMID 9856458 . S2CID 12354383 .
Bibel M, Hoppe E, Barde YA (1999). "Interactions biochimiques et fonctionnelles entre les récepteurs de neurotrophine trk et p75NTR" . EMBO J . 18 (3) : 616-22. doi : 10.1093/emboj/18.3.616 . PMC 1171154 . PMID 9927421 .
Yamada M, Ohnishi H, Sano S, Araki T, Nakatani A, Ikeuchi T, Hatanaka H (1999). « Le facteur neurotrophique dérivé du cerveau stimule les interactions de Shp2 avec la phosphatidylinositol 3-kinase et Grb2 dans les neurones corticaux cérébraux en culture ». J. Neurochem . 73 (1) : 41-9. doi : 10.1046/j.1471-4159.1999.0730041.x . PMID 10386953 . S2CID 25333848 .
Ultsch MH, Wiesmann C, Simmons LC, Henrich J, Yang M, Reilly D, Bass SH, de Vos AM (1999). « Structures cristallines du domaine de liaison aux neurotrophines de TrkA, TrkB et TrkC ». J. Mol. Biol . 290 (1) : 149-59. doi : 10.1006/jmbi.1999.2816 . PMID 10388563 .

Liens externes

Des souvenirs sont faits de cette molécule - New Scientist, 15 janvier 2007.

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