Coprinopsis cinerea -Coprinopsis cinerea
| Coprinopsis cinerea | |
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Classement scientifique 
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| Royaume: | Champignons |
| Division: | Basidiomycota |
| Classer: | Agaricomycètes |
| Commander: | Agaricales |
| Famille: | Psathyrellacées |
| Genre: | Coprinopsis |
| Espèce: |
C. cinerea
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| Nom binomial | |
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Coprinopsis cinerea ( Schaeff. ) Rousse, Vilgalys & Moncalvo (2001)
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| Synonymes | |
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Agaricus cinereus Schaeff. (1774) |
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Coprinopsis cinerea | |
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branchies sur hyménium |
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le capuchon est conique |
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l'hyménium est gratuit |
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le pied est nu |
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l'empreinte des spores est noire |
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l'écologie est saprotrophe |
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Comestibilité : comestible |
Coprinopsis cinerea est une espèce de champignon de la famille des Psathyrellaceae . Communément connu sous le nom de cormoran gris , il est comestible , mais doit être utilisé rapidement après la récolte.
Coprinopsis cinerea est un organisme modèle important pour l'étude du sexe et des types d'accouplement des champignons, du développement des champignons et de l'évolution de la multicellularité des champignons . La séquence du génome a été publiée en 2010. Il est considéré comme un organisme particulièrement adapté à l'étude de la méiose , en raison de son développement méiotique synchrone et de sa prophase prolongée .
Recherche
Antibiotiques
Des chercheurs ont découvert en 2014 une protéine produite par Coprinopsis cinerea aux propriétés antibiotiques. La protéine, connue sous le nom de copsine , a des effets similaires à ceux d'autres antibiotiques non protéiques d'origine organique. À ce jour, il n'a pas été déterminé si un médicament antibiotique pour l'homme et d'autres animaux peut être développé à partir de cette protéine.
Cultiver
Coprinopsis cinerea peut être cultivé sur des milieux complexes (ex. YMG, YMG/T) ou minimaux (ex. milieu mKjalke), solides ou liquides, avec ou sans agitation, à 25 °C ou de manière optimale à 37 °C. Il peut être cultivé dans l'obscurité ou avec un cycle d'obscurité de 12 h / 12 h.
Souches
- La souche PG78 de C. cinereus (A6B42, trp1.1;1.6, pab1) est une souche monocaryon AmutBmut, auto-compatible, avec des marqueurs trp- et pab-auxotrophes (nécessite du tryptophane et du p-aminobenzoate).
Génome
La souche Okayama 7 (#130) de Coprinopsis cinerea a été séquencée avec une couverture 10x en 2003. Une troisième et plus récente révision de la séquence de la souche Okayama 7 (#130) a été publiée en 2010. Son génome haploïde est d'environ. 37,5 Mo.
Clonage moléculaire
Coprinopsis cinerea peut être transformé avec de l'ADN exogène par transformation lorsque le champignon est un protoplaste. Il a été constaté que la perturbation (knockout ou silençage ARNi) de l' homologue ku70 peut augmenter le ciblage des gènes via une recombinaison homologue accrue. Des protoplastes dérivés de l'oïdie ou du mycélium végétatif peuvent être utilisés, cependant, le ciblage génique s'est avéré être supérieur de 2% (basé sur le phénotypage) lors de l'utilisation du mycélium végétatif. Sinon, l'insertion de vecteurs d'intégration par voie ectopique et avec de petites régions homologues peut être utilisée, probablement avec une faible efficacité de transformation. Auparavant, REMI (intégration médiée par des enzymes de restriction) pouvait être utilisé pour insérer de l'ADN exogène dans le chromosome pour produire des souches mutantes. Cela repose sur l'insertion d'ADN exogène et d'enzymes de restriction dans la cellule protoplaste, permettant aux enzymes de couper le chromosome à des sites spécifiques qui correspondent aux sites utilisés pour produire l'ADN plasmidique linéarisé avec le gène d'intérêt ; par la suite, les enzymes hôtes ligaturent les sites coupés et produisent ainsi un ADN hétérologue, exogène intégré. Bien que réussies, des mutations indésirables sont probables. Une mutagenèse chimique (également aléatoire) peut également être effectuée. La sélection du phénotype de l'incapacité à fructifier peut indiquer que l'insertion a conduit à la perturbation des gènes vitaux. Dans l'ensemble, la recombinaison homologue offre plus de spécificité lors de la création d'une souche mutante. Selon le mutant, des marqueurs d'auxotrophie (nécessite l'insertion d'un gène perdu) ou de prototrophie (lorsqu'ils provoquent une délétion de gène essentiel) peuvent être utilisés pour la sélection.
Enzymes
Coprinopsis cinerea est connu pour produire de la laccase , un type de phénoloxydase. C. cinerea produit une variété de la même laccase, appelée isoenzymes. L'activité laccase peut être mesurée par des zymogrammes (dans lesquels un substrat de l'enzyme est présent dans un gel de séparation). Dans des conditions de stress, de température et de milieu, la sécrétion de laccase a augmenté. Bien que le cuivre soit un cofacteur requis pour la laccase, le simple ajout de cuivre n'a pas induit la sécrétion de laccase. Il a été récemment découvert qu'un homologue TET (Ten-Eleven translocation dioxygenases), CcTET , a été identifié dans C. cinerea , ce qui peut avoir d'importantes implications humaines (ou mammifères) comme le cancer. La méthylation de l'ADN est vitale chez l'homme et le dysfonctionnement est associé au cancer. Par conséquent, l'étude des réactions de méthylation chez les non-mammifères peut fournir un meilleur aperçu des réactions de méthylation chez les mammifères.
la reproduction
Coprinopsis cinerea peut détecter la lumière bleue. Il a été identifié que le gène Cc.wc-2 est impliqué dans la photoréception de la lumière bleue. Les stipes étiolés (allongement sans maturation de la coiffe) sont causés lorsqu'ils sont cultivés sans lumière.
Méiose
Coprinopsis cinerea est un modèle idéal pour étudier la méiose car la méiose progresse de manière synchrone dans environ 10 millions de cellules dans chaque chapeau de champignon. La méiose est un processus de division cellulaire spécialisé, se produisant dans les cellules diploïdes, dans lequel un seul cycle de réplication de l'ADN se produit, et est suivi de deux divisions pour produire quatre noyaux filles haploïdes. Au cours de la méiose, les chromosomes homologues s'apparient et subissent un processus de réparation de l'ADN dans lequel les dommages à l'ADN sont supprimés et l'information génétique est recombinée. Burns et al. ont étudié l'expression des gènes impliqués dans le processus méiotique de 15 heures englobant des points dans le temps avant la fusion nucléaire haploïde qui forme le zygote diploïde jusqu'à la formation finale des quatre produits haploïdes. Ils ont comparé l'expression de gènes particuliers chez C. cinerea à l'expression de gènes comparables (orthologues) chez deux autres espèces ( Saccharomyces cerevisiae et Schizosaccharomyces pombe ) dont C. cinerea avait divergé il y a 500 à 900 millions d'années. Ils ont découvert que l'expression de gènes individuels était activée ou désactivée au même stade chez C. cinerea que chez les deux autres espèces. Ils ont également découvert que les gènes considérés comme spécifiquement impliqués dans le processus méiotique étaient plus conservés dans leur modèle d'expression que les gènes non méiotiques. Ces découvertes indiquent une ancienne conservation du processus méiotique.
Maladie humaine
Coprinopsis cinerea est inoffensif pour la santé humaine et animale dans des conditions normales. Cependant, l'organisme peut provoquer des infections opportunistes ( mycoses ) chez les patients immunodéprimés , tels que ceux qui ont subi une greffe de cellules souches hématopoïétiques ou qui suivent un traitement immunosuppresseur. La plupart des cas signalés ont été des infections respiratoires, mais des cas impliquant le cœur, la peau, le cerveau ou l'intestin ont été signalés, et les infections peuvent rapidement devenir systémiques. Bien qu'exceptionnellement rare, l' infection à Coprinopsis cinerea est difficile à traiter et souvent mortelle dans ce groupe de patients vulnérables. L'infection est causée par l' anamorphe asexuée (non champignonniste) de Coprinopsis cinerea, autrefois connue sous le nom d' Hormographiella aspergillata , et peut être décrite sous ce nom dans la littérature clinique.