Protéine de type ubiquitine procaryote - Prokaryotic ubiquitin-like protein
| Famille de protéines de type chiot | |||||||||||
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 Trois protéines de type ubiquitine procaryote (bleu) liées à l'ATPase protéasomale Mpa (rouge
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| Identifiants | |||||||||||
| symbole | chiot | ||||||||||
| Pfam | PF05639 | ||||||||||
| InterPro | IPR008515 | ||||||||||
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La protéine de type ubiquitine procaryote (Pup) est un analogue fonctionnel de l' ubiquitine trouvé dans le procaryote Mycobacterium tuberculosis . Comme l'ubiquitine, Pup sert à diriger les protéines vers le protéasome pour une dégradation dans le système Pup-protéasome ( PPS ). Cependant, l'enzymologie de l' ubiquitylation et de la pupylation est différente, en raison de leurs origines évolutives distinctes. Contrairement à la réaction en trois étapes de l'ubiquitylation, la pupylation ne nécessite que deux étapes, et donc seulement deux enzymes sont impliquées dans la pupylation. Les enzymes impliquées dans la pupylation descendent de la glutamine synthétase .
Semblable à l'ubiquitine, Pup est attaché à des résidus lysine spécifiques de protéines substrats par des liaisons isopeptidiques ; c'est ce qu'on appelle la pupylation . Il est alors reconnu par la protéine Mycobacterium protéasomale ATPase (Mpa), dans un mécanisme qui induit le repliement de Pup. Mpa délivre la protéine substrat au protéasome pour la dégradation par couplage de l'hydrolyse de l'ATP.
La découverte de Pup indique que, comme les eucaryotes , les bactéries peuvent utiliser un modificateur de petites protéines pour contrôler la stabilité des protéines.
Le gène code pour une Pup acide 64-amino protéine avec une taille moléculaire d'environ 6,9 kDa .
Le chiot est une protéine intrinsèquement désordonnée . En 2010, des scientifiques du Brookhaven National Laboratory ont déterminé la structure cristalline aux rayons X du complexe entre Pup et son enzyme de libération Mpa 3M9D et ont découvert que Pup se liant à Mpa induit le repliement d'une hélice alpha unique.
En 2017, la présence d'homologues de Pup dans des espèces bactériennes en dehors du groupe des bactéries gram-positives a été signalée. Les homologues de Pup ont été appelés UBact (pour Ubiquitin Bacterial), bien que la distinction n'ait pas été prouvée comme étant phylogénétiquement étayée par une origine évolutive distincte et sans preuve expérimentale. UBact est un homologue de Pup, et se trouve dans plusieurs phylums de bactéries gram-négatives (Pup se trouve principalement dans le phylum bactérien gram-positif Actinobacteria ).
Voir également
Les références
Liens externes
- PupDB , une base de données de protéines pupylées et de sites de pupylation.